Protein–RNA interactions for Protein: Q00597

FANCC, Fanconi anemia group C protein, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCCQ00597 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FANCCQ00597 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FANCCQ00597 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FANCCQ00597 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FANCCQ00597 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FANCCQ00597 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FANCCQ00597 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FANCCQ00597 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FANCCQ00597 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FANCCQ00597 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FANCCQ00597 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FANCCQ00597 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
FANCCQ00597 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FANCCQ00597 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FANCCQ00597 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FANCCQ00597 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FANCCQ00597 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FANCCQ00597 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FANCCQ00597 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FANCCQ00597 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FANCCQ00597 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FANCCQ00597 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FANCCQ00597 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FANCCQ00597 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FANCCQ00597 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FANCCQ00597 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FANCCQ00597 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FANCCQ00597 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FANCCQ00597 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
FANCCQ00597 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FANCCQ00597 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FANCCQ00597 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FANCCQ00597 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FANCCQ00597 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FANCCQ00597 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FANCCQ00597 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FANCCQ00597 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FANCCQ00597 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FANCCQ00597 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FANCCQ00597 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FANCCQ00597 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FANCCQ00597 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FANCCQ00597 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FANCCQ00597 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FANCCQ00597 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FANCCQ00597 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FANCCQ00597 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FANCCQ00597 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FANCCQ00597 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FANCCQ00597 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FANCCQ00597 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FANCCQ00597 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FANCCQ00597 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FANCCQ00597 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FANCCQ00597 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FANCCQ00597 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FANCCQ00597 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FANCCQ00597 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FANCCQ00597 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FANCCQ00597 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FANCCQ00597 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FANCCQ00597 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FANCCQ00597 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FANCCQ00597 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FANCCQ00597 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FANCCQ00597 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FANCCQ00597 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FANCCQ00597 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FANCCQ00597 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FANCCQ00597 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FANCCQ00597 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FANCCQ00597 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FANCCQ00597 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FANCCQ00597 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FANCCQ00597 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FANCCQ00597 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FANCCQ00597 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FANCCQ00597 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FANCCQ00597 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FANCCQ00597 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FANCCQ00597 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FANCCQ00597 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FANCCQ00597 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FANCCQ00597 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FANCCQ00597 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FANCCQ00597 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FANCCQ00597 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FANCCQ00597 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FANCCQ00597 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FANCCQ00597 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FANCCQ00597 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FANCCQ00597 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FANCCQ00597 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FANCCQ00597 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FANCCQ00597 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FANCCQ00597 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
FANCCQ00597 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FANCCQ00597 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
FANCCQ00597 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
FANCCQ00597 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms