Protein–RNA interactions for Protein: P78396

CCNA1, Cyclin-A1, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNA1P78396 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCNA1P78396 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CCNA1P78396 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCNA1P78396 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCNA1P78396 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCNA1P78396 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCNA1P78396 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CCNA1P78396 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCNA1P78396 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCNA1P78396 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCNA1P78396 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCNA1P78396 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCNA1P78396 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCNA1P78396 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCNA1P78396 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCNA1P78396 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCNA1P78396 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCNA1P78396 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCNA1P78396 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCNA1P78396 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCNA1P78396 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCNA1P78396 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCNA1P78396 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCNA1P78396 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCNA1P78396 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCNA1P78396 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCNA1P78396 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CCNA1P78396 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCNA1P78396 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCNA1P78396 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCNA1P78396 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCNA1P78396 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CCNA1P78396 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CCNA1P78396 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCNA1P78396 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCNA1P78396 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCNA1P78396 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCNA1P78396 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCNA1P78396 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCNA1P78396 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCNA1P78396 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCNA1P78396 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CCNA1P78396 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCNA1P78396 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCNA1P78396 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCNA1P78396 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCNA1P78396 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CCNA1P78396 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCNA1P78396 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCNA1P78396 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCNA1P78396 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CCNA1P78396 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCNA1P78396 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCNA1P78396 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCNA1P78396 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCNA1P78396 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CCNA1P78396 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCNA1P78396 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCNA1P78396 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CCNA1P78396 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCNA1P78396 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCNA1P78396 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCNA1P78396 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCNA1P78396 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCNA1P78396 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCNA1P78396 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCNA1P78396 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCNA1P78396 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CCNA1P78396 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCNA1P78396 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCNA1P78396 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCNA1P78396 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CCNA1P78396 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCNA1P78396 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCNA1P78396 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCNA1P78396 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCNA1P78396 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCNA1P78396 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCNA1P78396 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCNA1P78396 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCNA1P78396 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCNA1P78396 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCNA1P78396 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCNA1P78396 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCNA1P78396 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCNA1P78396 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CCNA1P78396 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCNA1P78396 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCNA1P78396 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCNA1P78396 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCNA1P78396 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCNA1P78396 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCNA1P78396 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CCNA1P78396 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCNA1P78396 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCNA1P78396 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCNA1P78396 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCNA1P78396 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCNA1P78396 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCNA1P78396 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms