Protein–RNA interactions for Protein: P68133

ACTA1, Actin, alpha skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTA1P68133 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ACTA1P68133 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ACTA1P68133 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ACTA1P68133 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ACTA1P68133 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ACTA1P68133 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ACTA1P68133 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ACTA1P68133 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ACTA1P68133 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ACTA1P68133 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ACTA1P68133 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ACTA1P68133 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ACTA1P68133 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ACTA1P68133 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ACTA1P68133 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ACTA1P68133 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ACTA1P68133 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ACTA1P68133 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ACTA1P68133 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ACTA1P68133 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ACTA1P68133 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ACTA1P68133 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
ACTA1P68133 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ACTA1P68133 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ACTA1P68133 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ACTA1P68133 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ACTA1P68133 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ACTA1P68133 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ACTA1P68133 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ACTA1P68133 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ACTA1P68133 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ACTA1P68133 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ACTA1P68133 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
ACTA1P68133 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ACTA1P68133 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ACTA1P68133 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ACTA1P68133 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ACTA1P68133 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
ACTA1P68133 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
ACTA1P68133 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ACTA1P68133 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ACTA1P68133 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ACTA1P68133 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ACTA1P68133 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
ACTA1P68133 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ACTA1P68133 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ACTA1P68133 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ACTA1P68133 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ACTA1P68133 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ACTA1P68133 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ACTA1P68133 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ACTA1P68133 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ACTA1P68133 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ACTA1P68133 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ACTA1P68133 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ACTA1P68133 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ACTA1P68133 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ACTA1P68133 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ACTA1P68133 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
ACTA1P68133 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ACTA1P68133 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ACTA1P68133 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ACTA1P68133 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ACTA1P68133 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ACTA1P68133 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ACTA1P68133 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ACTA1P68133 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ACTA1P68133 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ACTA1P68133 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
ACTA1P68133 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ACTA1P68133 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ACTA1P68133 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ACTA1P68133 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ACTA1P68133 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ACTA1P68133 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ACTA1P68133 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ACTA1P68133 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ACTA1P68133 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ACTA1P68133 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ACTA1P68133 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ACTA1P68133 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ACTA1P68133 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ACTA1P68133 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ACTA1P68133 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ACTA1P68133 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ACTA1P68133 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ACTA1P68133 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ACTA1P68133 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ACTA1P68133 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ACTA1P68133 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ACTA1P68133 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ACTA1P68133 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ACTA1P68133 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ACTA1P68133 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ACTA1P68133 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ACTA1P68133 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ACTA1P68133 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ACTA1P68133 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ACTA1P68133 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ACTA1P68133 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms