Protein–RNA interactions for Protein: P63121

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Pro protein, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P63121 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
HERVK_113P63121 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
HERVK_113P63121 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
HERVK_113P63121 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
HERVK_113P63121 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
HERVK_113P63121 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
HERVK_113P63121 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
HERVK_113P63121 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
HERVK_113P63121 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
HERVK_113P63121 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
HERVK_113P63121 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
HERVK_113P63121 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
HERVK_113P63121 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
HERVK_113P63121 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
HERVK_113P63121 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
HERVK_113P63121 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
HERVK_113P63121 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
HERVK_113P63121 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
HERVK_113P63121 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
HERVK_113P63121 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
HERVK_113P63121 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
HERVK_113P63121 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
HERVK_113P63121 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
HERVK_113P63121 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
HERVK_113P63121 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
HERVK_113P63121 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
HERVK_113P63121 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
HERVK_113P63121 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
HERVK_113P63121 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
HERVK_113P63121 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
HERVK_113P63121 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
HERVK_113P63121 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
HERVK_113P63121 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC13.83□□□□□ -0.19
HERVK_113P63121 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
HERVK_113P63121 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
HERVK_113P63121 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
HERVK_113P63121 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
HERVK_113P63121 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
HERVK_113P63121 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
HERVK_113P63121 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
HERVK_113P63121 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
HERVK_113P63121 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
HERVK_113P63121 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
HERVK_113P63121 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
HERVK_113P63121 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
HERVK_113P63121 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
HERVK_113P63121 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
HERVK_113P63121 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
HERVK_113P63121 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
HERVK_113P63121 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
HERVK_113P63121 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
HERVK_113P63121 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
HERVK_113P63121 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
HERVK_113P63121 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
HERVK_113P63121 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
HERVK_113P63121 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
HERVK_113P63121 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
HERVK_113P63121 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
HERVK_113P63121 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
HERVK_113P63121 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
HERVK_113P63121 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
HERVK_113P63121 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
HERVK_113P63121 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
HERVK_113P63121 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
HERVK_113P63121 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
HERVK_113P63121 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
HERVK_113P63121 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
HERVK_113P63121 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
HERVK_113P63121 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
HERVK_113P63121 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
HERVK_113P63121 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
HERVK_113P63121 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
HERVK_113P63121 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
HERVK_113P63121 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
HERVK_113P63121 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
HERVK_113P63121 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
HERVK_113P63121 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
HERVK_113P63121 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
HERVK_113P63121 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
HERVK_113P63121 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
HERVK_113P63121 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
HERVK_113P63121 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
HERVK_113P63121 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
HERVK_113P63121 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
HERVK_113P63121 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
HERVK_113P63121 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
HERVK_113P63121 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
HERVK_113P63121 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
HERVK_113P63121 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
HERVK_113P63121 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
HERVK_113P63121 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
HERVK_113P63121 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
HERVK_113P63121 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
HERVK_113P63121 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
HERVK_113P63121 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
HERVK_113P63121 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
HERVK_113P63121 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
HERVK_113P63121 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
HERVK_113P63121 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
HERVK_113P63121 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms