Protein–RNA interactions for Protein: P57075

UBASH3A, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein A, humanhuman

Predictions only

Length 661 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBASH3AP57075 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
UBASH3AP57075 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
UBASH3AP57075 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
UBASH3AP57075 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
UBASH3AP57075 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
UBASH3AP57075 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
UBASH3AP57075 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
UBASH3AP57075 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
UBASH3AP57075 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
UBASH3AP57075 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
UBASH3AP57075 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
UBASH3AP57075 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
UBASH3AP57075 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
UBASH3AP57075 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
UBASH3AP57075 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
UBASH3AP57075 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
UBASH3AP57075 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
UBASH3AP57075 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
UBASH3AP57075 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
UBASH3AP57075 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
UBASH3AP57075 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
UBASH3AP57075 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
UBASH3AP57075 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
UBASH3AP57075 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
UBASH3AP57075 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
UBASH3AP57075 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
UBASH3AP57075 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
UBASH3AP57075 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
UBASH3AP57075 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
UBASH3AP57075 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
UBASH3AP57075 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
UBASH3AP57075 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
UBASH3AP57075 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
UBASH3AP57075 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
UBASH3AP57075 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
UBASH3AP57075 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
UBASH3AP57075 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
UBASH3AP57075 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
UBASH3AP57075 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
UBASH3AP57075 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
UBASH3AP57075 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
UBASH3AP57075 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
UBASH3AP57075 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
UBASH3AP57075 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
UBASH3AP57075 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
UBASH3AP57075 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
UBASH3AP57075 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
UBASH3AP57075 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
UBASH3AP57075 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
UBASH3AP57075 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
UBASH3AP57075 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
UBASH3AP57075 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
UBASH3AP57075 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
UBASH3AP57075 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
UBASH3AP57075 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
UBASH3AP57075 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
UBASH3AP57075 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
UBASH3AP57075 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
UBASH3AP57075 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
UBASH3AP57075 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
UBASH3AP57075 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
UBASH3AP57075 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
UBASH3AP57075 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
UBASH3AP57075 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
UBASH3AP57075 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
UBASH3AP57075 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
UBASH3AP57075 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
UBASH3AP57075 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
UBASH3AP57075 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
UBASH3AP57075 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
UBASH3AP57075 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
UBASH3AP57075 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
UBASH3AP57075 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
UBASH3AP57075 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
UBASH3AP57075 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
UBASH3AP57075 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
UBASH3AP57075 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
UBASH3AP57075 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
UBASH3AP57075 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
UBASH3AP57075 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
UBASH3AP57075 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
UBASH3AP57075 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
UBASH3AP57075 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
UBASH3AP57075 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
UBASH3AP57075 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
UBASH3AP57075 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
UBASH3AP57075 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
UBASH3AP57075 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
UBASH3AP57075 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
UBASH3AP57075 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
UBASH3AP57075 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
UBASH3AP57075 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
UBASH3AP57075 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
UBASH3AP57075 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
UBASH3AP57075 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
UBASH3AP57075 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
UBASH3AP57075 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
UBASH3AP57075 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
UBASH3AP57075 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
UBASH3AP57075 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms