Protein–RNA interactions for Protein: P57059

SIK1, Serine/threonine-protein kinase SIK1, humanhuman

Predictions only

Length 783 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIK1P57059 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SIK1P57059 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SIK1P57059 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
SIK1P57059 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
SIK1P57059 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SIK1P57059 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SIK1P57059 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SIK1P57059 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SIK1P57059 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SIK1P57059 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SIK1P57059 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SIK1P57059 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SIK1P57059 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SIK1P57059 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SIK1P57059 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SIK1P57059 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SIK1P57059 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SIK1P57059 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SIK1P57059 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SIK1P57059 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SIK1P57059 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SIK1P57059 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SIK1P57059 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SIK1P57059 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SIK1P57059 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SIK1P57059 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SIK1P57059 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SIK1P57059 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SIK1P57059 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SIK1P57059 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SIK1P57059 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SIK1P57059 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SIK1P57059 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SIK1P57059 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SIK1P57059 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SIK1P57059 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SIK1P57059 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SIK1P57059 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SIK1P57059 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
SIK1P57059 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SIK1P57059 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SIK1P57059 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
SIK1P57059 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SIK1P57059 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SIK1P57059 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SIK1P57059 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SIK1P57059 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SIK1P57059 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SIK1P57059 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SIK1P57059 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SIK1P57059 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
SIK1P57059 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SIK1P57059 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SIK1P57059 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SIK1P57059 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SIK1P57059 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
SIK1P57059 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SIK1P57059 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SIK1P57059 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SIK1P57059 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SIK1P57059 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SIK1P57059 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SIK1P57059 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SIK1P57059 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SIK1P57059 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SIK1P57059 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SIK1P57059 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SIK1P57059 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SIK1P57059 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SIK1P57059 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SIK1P57059 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SIK1P57059 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SIK1P57059 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SIK1P57059 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SIK1P57059 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SIK1P57059 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SIK1P57059 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SIK1P57059 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
SIK1P57059 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SIK1P57059 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SIK1P57059 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SIK1P57059 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SIK1P57059 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SIK1P57059 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
SIK1P57059 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SIK1P57059 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SIK1P57059 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SIK1P57059 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SIK1P57059 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SIK1P57059 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SIK1P57059 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SIK1P57059 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SIK1P57059 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
SIK1P57059 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SIK1P57059 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SIK1P57059 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SIK1P57059 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SIK1P57059 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SIK1P57059 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SIK1P57059 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms