Protein–RNA interactions for Protein: P56182

RRP1, Ribosomal RNA processing protein 1 homolog A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRP1P56182 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RRP1P56182 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RRP1P56182 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RRP1P56182 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RRP1P56182 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RRP1P56182 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RRP1P56182 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RRP1P56182 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RRP1P56182 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RRP1P56182 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RRP1P56182 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RRP1P56182 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RRP1P56182 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RRP1P56182 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RRP1P56182 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RRP1P56182 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RRP1P56182 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RRP1P56182 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RRP1P56182 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RRP1P56182 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RRP1P56182 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RRP1P56182 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RRP1P56182 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RRP1P56182 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RRP1P56182 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RRP1P56182 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RRP1P56182 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RRP1P56182 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RRP1P56182 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RRP1P56182 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RRP1P56182 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RRP1P56182 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RRP1P56182 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RRP1P56182 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RRP1P56182 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RRP1P56182 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RRP1P56182 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RRP1P56182 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RRP1P56182 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RRP1P56182 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RRP1P56182 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RRP1P56182 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RRP1P56182 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RRP1P56182 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RRP1P56182 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RRP1P56182 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RRP1P56182 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RRP1P56182 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RRP1P56182 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RRP1P56182 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RRP1P56182 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RRP1P56182 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RRP1P56182 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
RRP1P56182 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RRP1P56182 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RRP1P56182 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RRP1P56182 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RRP1P56182 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RRP1P56182 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RRP1P56182 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RRP1P56182 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RRP1P56182 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RRP1P56182 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RRP1P56182 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RRP1P56182 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RRP1P56182 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RRP1P56182 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RRP1P56182 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RRP1P56182 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RRP1P56182 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RRP1P56182 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RRP1P56182 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RRP1P56182 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RRP1P56182 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RRP1P56182 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RRP1P56182 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RRP1P56182 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RRP1P56182 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
RRP1P56182 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RRP1P56182 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RRP1P56182 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RRP1P56182 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RRP1P56182 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RRP1P56182 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RRP1P56182 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
RRP1P56182 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RRP1P56182 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RRP1P56182 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RRP1P56182 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RRP1P56182 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RRP1P56182 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RRP1P56182 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RRP1P56182 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RRP1P56182 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RRP1P56182 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RRP1P56182 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RRP1P56182 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
RRP1P56182 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RRP1P56182 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RRP1P56182 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms