Protein–RNA interactions for Protein: P55075

FGF8, Fibroblast growth factor 8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGF8P55075 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FGF8P55075 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FGF8P55075 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FGF8P55075 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FGF8P55075 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FGF8P55075 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FGF8P55075 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FGF8P55075 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FGF8P55075 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
FGF8P55075 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FGF8P55075 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FGF8P55075 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FGF8P55075 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FGF8P55075 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FGF8P55075 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FGF8P55075 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FGF8P55075 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FGF8P55075 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
FGF8P55075 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FGF8P55075 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FGF8P55075 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FGF8P55075 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FGF8P55075 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FGF8P55075 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FGF8P55075 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FGF8P55075 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FGF8P55075 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FGF8P55075 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FGF8P55075 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FGF8P55075 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FGF8P55075 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FGF8P55075 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FGF8P55075 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
FGF8P55075 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
FGF8P55075 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
FGF8P55075 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
FGF8P55075 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FGF8P55075 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FGF8P55075 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FGF8P55075 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FGF8P55075 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FGF8P55075 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FGF8P55075 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FGF8P55075 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FGF8P55075 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FGF8P55075 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FGF8P55075 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FGF8P55075 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
FGF8P55075 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FGF8P55075 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FGF8P55075 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FGF8P55075 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FGF8P55075 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FGF8P55075 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FGF8P55075 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FGF8P55075 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FGF8P55075 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FGF8P55075 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FGF8P55075 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FGF8P55075 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
FGF8P55075 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
FGF8P55075 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FGF8P55075 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FGF8P55075 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FGF8P55075 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FGF8P55075 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
FGF8P55075 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FGF8P55075 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FGF8P55075 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FGF8P55075 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FGF8P55075 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FGF8P55075 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FGF8P55075 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FGF8P55075 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FGF8P55075 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FGF8P55075 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FGF8P55075 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FGF8P55075 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FGF8P55075 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FGF8P55075 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FGF8P55075 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FGF8P55075 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FGF8P55075 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FGF8P55075 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FGF8P55075 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FGF8P55075 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FGF8P55075 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FGF8P55075 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FGF8P55075 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FGF8P55075 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FGF8P55075 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FGF8P55075 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FGF8P55075 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FGF8P55075 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FGF8P55075 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FGF8P55075 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FGF8P55075 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FGF8P55075 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FGF8P55075 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FGF8P55075 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms