Protein–RNA interactions for Protein: P53680

AP2S1, AP-2 complex subunit sigma, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP2S1P53680 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
AP2S1P53680 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
AP2S1P53680 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
AP2S1P53680 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
AP2S1P53680 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
AP2S1P53680 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
AP2S1P53680 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
AP2S1P53680 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
AP2S1P53680 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
AP2S1P53680 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
AP2S1P53680 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
AP2S1P53680 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
AP2S1P53680 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
AP2S1P53680 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
AP2S1P53680 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
AP2S1P53680 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
AP2S1P53680 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
AP2S1P53680 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
AP2S1P53680 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
AP2S1P53680 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
AP2S1P53680 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
AP2S1P53680 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
AP2S1P53680 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
AP2S1P53680 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
AP2S1P53680 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
AP2S1P53680 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
AP2S1P53680 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
AP2S1P53680 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
AP2S1P53680 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
AP2S1P53680 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
AP2S1P53680 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
AP2S1P53680 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
AP2S1P53680 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
AP2S1P53680 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
AP2S1P53680 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
AP2S1P53680 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
AP2S1P53680 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
AP2S1P53680 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
AP2S1P53680 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
AP2S1P53680 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
AP2S1P53680 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
AP2S1P53680 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
AP2S1P53680 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
AP2S1P53680 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
AP2S1P53680 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
AP2S1P53680 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
AP2S1P53680 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
AP2S1P53680 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
AP2S1P53680 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
AP2S1P53680 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
AP2S1P53680 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC17■□□□□ 0.31
AP2S1P53680 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
AP2S1P53680 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
AP2S1P53680 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
AP2S1P53680 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
AP2S1P53680 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
AP2S1P53680 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
AP2S1P53680 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
AP2S1P53680 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
AP2S1P53680 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
AP2S1P53680 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
AP2S1P53680 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
AP2S1P53680 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
AP2S1P53680 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC17■□□□□ 0.31
AP2S1P53680 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
AP2S1P53680 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
AP2S1P53680 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
AP2S1P53680 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
AP2S1P53680 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
AP2S1P53680 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC17■□□□□ 0.31
AP2S1P53680 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
AP2S1P53680 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
AP2S1P53680 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
AP2S1P53680 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
AP2S1P53680 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
AP2S1P53680 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
AP2S1P53680 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
AP2S1P53680 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
AP2S1P53680 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
AP2S1P53680 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
AP2S1P53680 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
AP2S1P53680 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
AP2S1P53680 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
AP2S1P53680 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
AP2S1P53680 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
AP2S1P53680 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
AP2S1P53680 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
AP2S1P53680 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
AP2S1P53680 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
AP2S1P53680 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
AP2S1P53680 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
AP2S1P53680 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
AP2S1P53680 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
AP2S1P53680 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
AP2S1P53680 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
AP2S1P53680 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
AP2S1P53680 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
AP2S1P53680 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
AP2S1P53680 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
AP2S1P53680 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms