Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PGGT1BP53609 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PGGT1BP53609 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PGGT1BP53609 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PGGT1BP53609 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PGGT1BP53609 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PGGT1BP53609 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PGGT1BP53609 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PGGT1BP53609 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PGGT1BP53609 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PGGT1BP53609 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PGGT1BP53609 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PGGT1BP53609 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
PGGT1BP53609 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PGGT1BP53609 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PGGT1BP53609 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PGGT1BP53609 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PGGT1BP53609 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PGGT1BP53609 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PGGT1BP53609 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
PGGT1BP53609 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PGGT1BP53609 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PGGT1BP53609 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PGGT1BP53609 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PGGT1BP53609 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PGGT1BP53609 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PGGT1BP53609 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PGGT1BP53609 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PGGT1BP53609 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PGGT1BP53609 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PGGT1BP53609 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PGGT1BP53609 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PGGT1BP53609 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PGGT1BP53609 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PGGT1BP53609 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PGGT1BP53609 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PGGT1BP53609 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PGGT1BP53609 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
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PGGT1BP53609 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PGGT1BP53609 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
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PGGT1BP53609 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
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PGGT1BP53609 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
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PGGT1BP53609 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
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PGGT1BP53609 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PGGT1BP53609 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PGGT1BP53609 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PGGT1BP53609 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PGGT1BP53609 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PGGT1BP53609 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PGGT1BP53609 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PGGT1BP53609 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PGGT1BP53609 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
PGGT1BP53609 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PGGT1BP53609 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PGGT1BP53609 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
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