Protein–RNA interactions for Protein: P53438

SOK2, Protein SOK2, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 785 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SOK2P53438 UBP15YMR304W 3693 nt2.4□□□□□ -2.03
SOK2P53438 GEA1YJR031C 4227 nt2.4□□□□□ -2.03
SOK2P53438 YJR039WYJR039W 3366 nt2.4□□□□□ -2.03
SOK2P53438 ISW1YBR245C 3390 nt2.4□□□□□ -2.03
SOK2P53438 PKH2YOL100W 3246 nt2.4□□□□□ -2.03
SOK2P53438 SPF1YEL031W 3648 nt2.4□□□□□ -2.03
SOK2P53438 MLH1YMR167W 2310 nt2.39□□□□□ -2.03
SOK2P53438 YGR109W-BYGR109W-B 4644 nt2.39□□□□□ -2.03
SOK2P53438 LHS1YKL073W 2646 nt2.39□□□□□ -2.03
SOK2P53438 YPL150WYPL150W 2706 nt2.39□□□□□ -2.03
SOK2P53438 COG4YPR105C 2586 nt2.38□□□□□ -2.03
SOK2P53438 QCR9YGR183C 201 nt2.38□□□□□ -2.03
SOK2P53438 STB6YKL072W 2301 nt2.38□□□□□ -2.03
SOK2P53438 YLL020CYLL020C 306 nt2.38□□□□□ -2.03
SOK2P53438 NUP100YKL068W 2880 nt2.38□□□□□ -2.03
SOK2P53438 RCO1YMR075W 2055 nt2.37□□□□□ -2.03
SOK2P53438 YAL067W-AYAL067W-A 228 nt2.37□□□□□ -2.03
SOK2P53438 AGC1YPR021C 2709 nt2.37□□□□□ -2.03
SOK2P53438 SLN1YIL147C 3663 nt2.37□□□□□ -2.03
SOK2P53438 UBP1YDL122W 2430 nt2.37□□□□□ -2.03
SOK2P53438 YMR175W-AYMR175W-A 195 nt2.36□□□□□ -2.03
SOK2P53438 SLI15YBR156C 2097 nt2.36□□□□□ -2.03
SOK2P53438 NAB6YML117W 3405 nt2.35□□□□□ -2.03
SOK2P53438 YHR131W-AYHR131W-A 246 nt2.35□□□□□ -2.03
SOK2P53438 snR70snR70 164 nt2.34□□□□□ -2.03
SOK2P53438 UBR1YGR184C 5853 nt2.34□□□□□ -2.03
SOK2P53438 CTR9YOL145C 3234 nt2.34□□□□□ -2.04
SOK2P53438 CSF1YLR087C 8877 nt2.33□□□□□ -2.04
SOK2P53438 YOL098CYOL098C 3114 nt2.33□□□□□ -2.04
SOK2P53438 VPS13YLL040C 9435 nt2.33□□□□□ -2.04
SOK2P53438 TRM3YDL112W 4311 nt2.33□□□□□ -2.04
SOK2P53438 UTP8YGR128C 2142 nt2.33□□□□□ -2.04
SOK2P53438 SEC26YDR238C 2922 nt2.33□□□□□ -2.04
SOK2P53438 PDR3YBL005W 2931 nt2.33□□□□□ -2.04
SOK2P53438 YDL206WYDL206W 2289 nt2.33□□□□□ -2.04
SOK2P53438 SSD1YDR293C 3753 nt2.32□□□□□ -2.04
SOK2P53438 BFR2YDR299W 1605 nt2.32□□□□□ -2.04
SOK2P53438 RPL37BYDR500C 267 nt2.32□□□□□ -2.04
SOK2P53438 tW(CCA)G1tW(CCA)G1 72 nt2.32□□□□□ -2.04
SOK2P53438 tW(CCA)G2tW(CCA)G2 72 nt2.32□□□□□ -2.04
SOK2P53438 tW(CCA)JtW(CCA)J 72 nt2.32□□□□□ -2.04
SOK2P53438 tW(CCA)KtW(CCA)K 72 nt2.32□□□□□ -2.04
SOK2P53438 tW(CCA)MtW(CCA)M 72 nt2.32□□□□□ -2.04
SOK2P53438 tW(CCA)PtW(CCA)P 72 nt2.32□□□□□ -2.04
SOK2P53438 RPS29AYLR388W 171 nt2.32□□□□□ -2.04
SOK2P53438 YBL039C-AYBL039C-A 84 nt2.32□□□□□ -2.04
SOK2P53438 BNR1YIL159W 4128 nt2.32□□□□□ -2.04
SOK2P53438 UFD2YDL190C 2886 nt2.31□□□□□ -2.04
SOK2P53438 snR39BsnR39B 96 nt2.31□□□□□ -2.04
SOK2P53438 POL5YEL055C 3069 nt2.31□□□□□ -2.04
SOK2P53438 ARP8YOR141C 2646 nt2.31□□□□□ -2.04
SOK2P53438 ADR1YDR216W 3972 nt2.31□□□□□ -2.04
SOK2P53438 IST2YBR086C 2841 nt2.3□□□□□ -2.04
SOK2P53438 snR81snR81 201 nt2.3□□□□□ -2.04
SOK2P53438 YGL123C-AYGL123C-A 231 nt2.3□□□□□ -2.04
SOK2P53438 SEC63YOR254C 1992 nt2.3□□□□□ -2.04
SOK2P53438 SGM1YJR134C 2124 nt2.3□□□□□ -2.04
SOK2P53438 FAR11YNL127W 2862 nt2.3□□□□□ -2.04
SOK2P53438 TDA9YML081W 3756 nt2.3□□□□□ -2.04
SOK2P53438 TRL1YJL087C 2484 nt2.29□□□□□ -2.04
SOK2P53438 SVL3YPL032C 2478 nt2.29□□□□□ -2.04
SOK2P53438 RTT107YHR154W 3213 nt2.29□□□□□ -2.04
SOK2P53438 SYH1YPL105C 2550 nt2.28□□□□□ -2.04
SOK2P53438 EAF1YDR359C 2949 nt2.28□□□□□ -2.04
SOK2P53438 FKS3YMR306W 5358 nt2.28□□□□□ -2.04
SOK2P53438 YKL100W-AYKL100W-A 90 nt2.27□□□□□ -2.05
SOK2P53438 PDR1YGL013C 3207 nt2.27□□□□□ -2.05
SOK2P53438 CDC60YPL160W 3273 nt2.26□□□□□ -2.05
SOK2P53438 PSD2YGR170W 3417 nt2.26□□□□□ -2.05
SOK2P53438 MDS3YGL197W 4464 nt2.26□□□□□ -2.05
SOK2P53438 TOP2YNL088W 4287 nt2.26□□□□□ -2.05
SOK2P53438 TBS1YBR150C 3285 nt2.25□□□□□ -2.05
SOK2P53438 FRK1YPL141C 2598 nt2.25□□□□□ -2.05
SOK2P53438 NUM1YDR150W 8247 nt2.25□□□□□ -2.05
SOK2P53438 RIF1YBR275C 5751 nt2.24□□□□□ -2.05
SOK2P53438 YAL037C-AYAL037C-A 93 nt2.24□□□□□ -2.05
SOK2P53438 IRE1YHR079C 3348 nt2.24□□□□□ -2.05
SOK2P53438 GCN2YDR283C 4980 nt2.24□□□□□ -2.05
SOK2P53438 PET309YLR067C 2898 nt2.23□□□□□ -2.05
SOK2P53438 TAH1YCR060W 336 nt2.22□□□□□ -2.05
SOK2P53438 snR62snR62 100 nt2.22□□□□□ -2.05
SOK2P53438 COX5BYIL111W 456 nt2.22□□□□□ -2.05
SOK2P53438 SGS1YMR190C 4344 nt2.22□□□□□ -2.05
SOK2P53438 COG6YNL041C 2520 nt2.22□□□□□ -2.05
SOK2P53438 tM(CAU)Q2tM(CAU)Q2 78 nt2.21□□□□□ -2.06
SOK2P53438 RSM22YKL155C 1887 nt2.21□□□□□ -2.06
SOK2P53438 TRA1YHR099W 11235 nt2.2□□□□□ -2.06
SOK2P53438 KRE33YNL132W 3171 nt2.2□□□□□ -2.06
SOK2P53438 YOR161W-AYOR161W-A 81 nt2.2□□□□□ -2.06
SOK2P53438 YER172C-AYER172C-A 381 nt2.19□□□□□ -2.06
SOK2P53438 YDR098C-BYDR098C-B 5268 nt2.19□□□□□ -2.06
SOK2P53438 YDR210C-DYDR210C-D 5268 nt2.19□□□□□ -2.06
SOK2P53438 YDR316W-BYDR316W-B 5268 nt2.19□□□□□ -2.06
SOK2P53438 YDR365W-BYDR365W-B 5268 nt2.19□□□□□ -2.06
SOK2P53438 YER138CYER138C 5268 nt2.19□□□□□ -2.06
SOK2P53438 YER160CYER160C 5268 nt2.19□□□□□ -2.06
SOK2P53438 YGR038C-BYGR038C-B 5268 nt2.19□□□□□ -2.06
SOK2P53438 YGR161C-DYGR161C-D 5268 nt2.19□□□□□ -2.06
SOK2P53438 YJR027WYJR027W 5268 nt2.19□□□□□ -2.06
SOK2P53438 YLR157C-BYLR157C-B 5268 nt2.19□□□□□ -2.06
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