Protein–RNA interactions for Protein: P53011

SEH1, Nucleoporin SEH1, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SEH1P53011 tV(UAC)BtV(UAC)B 74 nt1.14□□□□□ -2.23
SEH1P53011 tV(UAC)DtV(UAC)D 74 nt1.14□□□□□ -2.23
SEH1P53011 YPL225WYPL225W 441 nt1.14□□□□□ -2.23
SEH1P53011 YPR063CYPR063C 423 nt1.14□□□□□ -2.23
SEH1P53011 CLU1YMR012W 3834 nt1.14□□□□□ -2.23
SEH1P53011 YDR169C-AYDR169C-A 150 nt1.13□□□□□ -2.23
SEH1P53011 MAM33YIL070C 801 nt1.13□□□□□ -2.23
SEH1P53011 TAR1YLR154W-C 375 nt1.13□□□□□ -2.23
SEH1P53011 HUG1YML058W-A 207 nt1.13□□□□□ -2.23
SEH1P53011 SWI4YER111C 3282 nt1.13□□□□□ -2.23
SEH1P53011 MPT5YGL178W 2580 nt1.12□□□□□ -2.23
SEH1P53011 NUP188YML103C 4968 nt1.12□□□□□ -2.23
SEH1P53011 TTI1YKL033W 3117 nt1.12□□□□□ -2.23
SEH1P53011 YKL118WYKL118W 312 nt1.12□□□□□ -2.23
SEH1P53011 snR14snR14 160 nt1.12□□□□□ -2.23
SEH1P53011 COG4YPR105C 2586 nt1.12□□□□□ -2.23
SEH1P53011 RAD34YDR314C 2079 nt1.12□□□□□ -2.23
SEH1P53011 PKH2YOL100W 3246 nt1.11□□□□□ -2.23
SEH1P53011 SEC3YER008C 4011 nt1.11□□□□□ -2.23
SEH1P53011 LCD1YDR499W 2244 nt1.11□□□□□ -2.23
SEH1P53011 CUL3YGR003W 2235 nt1.11□□□□□ -2.23
SEH1P53011 NHP2YDL208W 471 nt1.11□□□□□ -2.23
SEH1P53011 YDR413CYDR413C 576 nt1.11□□□□□ -2.23
SEH1P53011 APL1YJR005W 2103 nt1.11□□□□□ -2.23
SEH1P53011 YLL020CYLL020C 306 nt1.11□□□□□ -2.23
SEH1P53011 FIG4YNL325C 2640 nt1.1□□□□□ -2.23
SEH1P53011 YFL032WYFL032W 321 nt1.1□□□□□ -2.23
SEH1P53011 YJR011CYJR011C 786 nt1.1□□□□□ -2.23
SEH1P53011 RPL33BYOR234C 324 nt1.1□□□□□ -2.23
SEH1P53011 SPT21YMR179W 2277 nt1.09□□□□□ -2.23
SEH1P53011 YIR044CYIR044C 186 nt1.09□□□□□ -2.23
SEH1P53011 SIP4YJL089W 2490 nt1.09□□□□□ -2.24
SEH1P53011 DBP6YNR038W 1890 nt1.08□□□□□ -2.24
SEH1P53011 GPG1YGL121C 381 nt1.08□□□□□ -2.24
SEH1P53011 RPL34BYIL052C 366 nt1.08□□□□□ -2.24
SEH1P53011 MMS4YBR098W 2076 nt1.08□□□□□ -2.24
SEH1P53011 YGL149WYGL149W 306 nt1.07□□□□□ -2.24
SEH1P53011 YBL008W-AYBL008W-A 240 nt1.07□□□□□ -2.24
SEH1P53011 SMC1YFL008W 3678 nt1.07□□□□□ -2.24
SEH1P53011 OST1YJL002C 1431 nt1.06□□□□□ -2.24
SEH1P53011 PTP2YOR208W 2253 nt1.06□□□□□ -2.24
SEH1P53011 YLL007CYLL007C 1998 nt1.06□□□□□ -2.24
SEH1P53011 NUP145YGL092W 3954 nt1.06□□□□□ -2.24
SEH1P53011 APL3YBL037W 3078 nt1.06□□□□□ -2.24
SEH1P53011 YDL206WYDL206W 2289 nt1.05□□□□□ -2.24
SEH1P53011 YAR009CYAR009C 3591 nt1.05□□□□□ -2.24
SEH1P53011 YER097WYER097W 330 nt1.05□□□□□ -2.24
SEH1P53011 EAF1YDR359C 2949 nt1.05□□□□□ -2.24
SEH1P53011 NST1YNL091W 3723 nt1.04□□□□□ -2.24
SEH1P53011 YDR183C-AYDR183C-A 258 nt1.04□□□□□ -2.24
SEH1P53011 YMR193C-AYMR193C-A 387 nt1.04□□□□□ -2.24
SEH1P53011 NIP100YPL174C 2607 nt1.04□□□□□ -2.24
SEH1P53011 STB6YKL072W 2301 nt1.04□□□□□ -2.24
SEH1P53011 YCK3YER123W 1575 nt1.04□□□□□ -2.24
SEH1P53011 CDC39YCR093W 6327 nt1.04□□□□□ -2.24
SEH1P53011 snR60snR60 104 nt1.03□□□□□ -2.24
SEH1P53011 YIL032CYIL032C 357 nt1.03□□□□□ -2.24
SEH1P53011 RPL39YJL189W 156 nt1.03□□□□□ -2.24
SEH1P53011 YBR221W-AYBR221W-A 105 nt1.03□□□□□ -2.24
SEH1P53011 SPT7YBR081C 3999 nt1.03□□□□□ -2.24
SEH1P53011 STO1YMR125W 2586 nt1.02□□□□□ -2.25
SEH1P53011 YJR029WYJR029W 5268 nt1.02□□□□□ -2.25
SEH1P53011 YPR137C-BYPR137C-B 5268 nt1.02□□□□□ -2.25
SEH1P53011 HTL1YCR020W-B 237 nt1.02□□□□□ -2.25
SEH1P53011 HMRA2YCR096C 360 nt1.02□□□□□ -2.25
SEH1P53011 SSS1YDR086C 243 nt1.02□□□□□ -2.25
SEH1P53011 ALY2YJL084C 3141 nt1.02□□□□□ -2.25
SEH1P53011 SCC2YDR180W 4482 nt1.02□□□□□ -2.25
SEH1P53011 VAM6YDL077C 3150 nt1.02□□□□□ -2.25
SEH1P53011 SLD3YGL113W 2007 nt1.01□□□□□ -2.25
SEH1P53011 STE5YDR103W 2754 nt1.01□□□□□ -2.25
SEH1P53011 YFL063WYFL063W 456 nt1.01□□□□□ -2.25
SEH1P53011 SET3YKR029C 2256 nt1.01□□□□□ -2.25
SEH1P53011 IFH1YLR223C 3258 nt1□□□□□ -2.25
SEH1P53011 PDE2YOR360C 1581 nt1□□□□□ -2.25
SEH1P53011 YMR031W-AYMR031W-A 327 nt1□□□□□ -2.25
SEH1P53011 ROM2YLR371W 4071 nt0.99□□□□□ -2.25
SEH1P53011 GEA2YEL022W 4380 nt0.99□□□□□ -2.25
SEH1P53011 ALG13YGL047W 609 nt0.99□□□□□ -2.25
SEH1P53011 YHL042WYHL042W 453 nt0.99□□□□□ -2.25
SEH1P53011 YBR200W-AYBR200W-A 165 nt0.99□□□□□ -2.25
SEH1P53011 WAR1YML076C 2835 nt0.99□□□□□ -2.25
SEH1P53011 YIL115W-AYIL115W-A 372 nt0.98□□□□□ -2.25
SEH1P53011 RPS25BYLR333C 327 nt0.98□□□□□ -2.25
SEH1P53011 YDR521WYDR521W 336 nt0.97□□□□□ -2.25
SEH1P53011 YNL146WYNL146W 303 nt0.97□□□□□ -2.25
SEH1P53011 VIK1YPL253C 1944 nt0.96□□□□□ -2.26
SEH1P53011 ECM12YHR021W-A 456 nt0.96□□□□□ -2.26
SEH1P53011 YOR011W-AYOR011W-A 207 nt0.96□□□□□ -2.26
SEH1P53011 YOR218CYOR218C 420 nt0.96□□□□□ -2.26
SEH1P53011 YBR206WYBR206W 324 nt0.95□□□□□ -2.26
SEH1P53011 UBP3YER151C 2739 nt0.95□□□□□ -2.26
SEH1P53011 NUP157YER105C 4176 nt0.95□□□□□ -2.26
SEH1P53011 YDR344CYDR344C 444 nt0.94□□□□□ -2.26
SEH1P53011 YMR321CYMR321C 318 nt0.94□□□□□ -2.26
SEH1P53011 CSE2YNR010W 450 nt0.94□□□□□ -2.26
SEH1P53011 BEM2YER155C 6504 nt0.93□□□□□ -2.26
SEH1P53011 RPS27BYHR021C 249 nt0.93□□□□□ -2.26
SEH1P53011 INA22YIR024C 651 nt0.93□□□□□ -2.26
SEH1P53011 SPO21YOL091W 1830 nt0.93□□□□□ -2.26
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 34.5 ms