Protein–RNA interactions for Protein: P52918

MSN5, Protein MSN5, yeastyeast

Predictions only

Length 1,224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
MSN5P52918 SMC6YLR383W 3345 nt2.84□□□□□ -1.96
MSN5P52918 ZIP1YDR285W 2628 nt2.83□□□□□ -1.96
MSN5P52918 PTP2YOR208W 2253 nt2.83□□□□□ -1.96
MSN5P52918 HSH155YMR288W 2916 nt2.83□□□□□ -1.96
MSN5P52918 NOP14YDL148C 2433 nt2.83□□□□□ -1.96
MSN5P52918 MSB1YOR188W 3414 nt2.83□□□□□ -1.96
MSN5P52918 ESL2YKR096W 3588 nt2.82□□□□□ -1.96
MSN5P52918 CDC53YDL132W 2448 nt2.82□□□□□ -1.96
MSN5P52918 YLL054CYLL054C 2532 nt2.82□□□□□ -1.96
MSN5P52918 SCD5YOR329C 2619 nt2.82□□□□□ -1.96
MSN5P52918 ESC1YMR219W 4977 nt2.81□□□□□ -1.96
MSN5P52918 YCR102W-AYCR102W-A 198 nt2.81□□□□□ -1.96
MSN5P52918 SLH1YGR271W 5904 nt2.8□□□□□ -1.96
MSN5P52918 YIL002W-AYIL002W-A 210 nt2.8□□□□□ -1.96
MSN5P52918 SRO77YBL106C 3033 nt2.8□□□□□ -1.96
MSN5P52918 ENV11YGR071C 2583 nt2.8□□□□□ -1.96
MSN5P52918 RCO1YMR075W 2055 nt2.8□□□□□ -1.96
MSN5P52918 IFH1YLR223C 3258 nt2.79□□□□□ -1.96
MSN5P52918 SSN2YDR443C 4263 nt2.78□□□□□ -1.96
MSN5P52918 DCP2YNL118C 2913 nt2.78□□□□□ -1.96
MSN5P52918 YJL026C-AYJL026C-A 222 nt2.78□□□□□ -1.96
MSN5P52918 YOR055WYOR055W 435 nt2.78□□□□□ -1.96
MSN5P52918 GEA1YJR031C 4227 nt2.77□□□□□ -1.97
MSN5P52918 YAL067W-AYAL067W-A 228 nt2.77□□□□□ -1.97
MSN5P52918 APL2YKL135C 2181 nt2.77□□□□□ -1.97
MSN5P52918 SGM1YJR134C 2124 nt2.77□□□□□ -1.97
MSN5P52918 YDR521WYDR521W 336 nt2.76□□□□□ -1.97
MSN5P52918 TTI1YKL033W 3117 nt2.76□□□□□ -1.97
MSN5P52918 SAP190YKR028W 3102 nt2.76□□□□□ -1.97
MSN5P52918 INP51YIL002C 2841 nt2.76□□□□□ -1.97
MSN5P52918 IRC8YJL051W 2469 nt2.76□□□□□ -1.97
MSN5P52918 NUP100YKL068W 2880 nt2.75□□□□□ -1.97
MSN5P52918 YGL182CYGL182C 324 nt2.75□□□□□ -1.97
MSN5P52918 QCR9YGR183C 201 nt2.75□□□□□ -1.97
MSN5P52918 CBF2YGR140W 2871 nt2.75□□□□□ -1.97
MSN5P52918 ISW1YBR245C 3390 nt2.74□□□□□ -1.97
MSN5P52918 ALK1YGL021W 2283 nt2.74□□□□□ -1.97
MSN5P52918 snR81snR81 201 nt2.74□□□□□ -1.97
MSN5P52918 YHR131W-AYHR131W-A 246 nt2.74□□□□□ -1.97
MSN5P52918 SIR4YDR227W 4077 nt2.73□□□□□ -1.97
MSN5P52918 TOR1YJR066W 7413 nt2.73□□□□□ -1.97
MSN5P52918 MMS22YLR320W 4365 nt2.71□□□□□ -1.98
MSN5P52918 YKR075W-AYKR075W-A 270 nt2.71□□□□□ -1.98
MSN5P52918 YNL018CYNL018C 1839 nt2.7□□□□□ -1.98
MSN5P52918 LHS1YKL073W 2646 nt2.7□□□□□ -1.98
MSN5P52918 SEC63YOR254C 1992 nt2.7□□□□□ -1.98
MSN5P52918 STB6YKL072W 2301 nt2.7□□□□□ -1.98
MSN5P52918 BNR1YIL159W 4128 nt2.7□□□□□ -1.98
MSN5P52918 YGR109W-BYGR109W-B 4644 nt2.69□□□□□ -1.98
MSN5P52918 YLR035C-AYLR035C-A 3468 nt2.69□□□□□ -1.98
MSN5P52918 snR39BsnR39B 96 nt2.69□□□□□ -1.98
MSN5P52918 MLH1YMR167W 2310 nt2.68□□□□□ -1.98
MSN5P52918 PSD2YGR170W 3417 nt2.68□□□□□ -1.98
MSN5P52918 MAK10YEL053C 2202 nt2.68□□□□□ -1.98
MSN5P52918 APL1YJR005W 2103 nt2.67□□□□□ -1.98
MSN5P52918 MRD1YPR112C 2664 nt2.67□□□□□ -1.98
MSN5P52918 MLH3YPL164C 2148 nt2.66□□□□□ -1.98
MSN5P52918 TOP2YNL088W 4287 nt2.66□□□□□ -1.98
MSN5P52918 AMS1YGL156W 3252 nt2.65□□□□□ -1.99
MSN5P52918 snR62snR62 100 nt2.65□□□□□ -1.99
MSN5P52918 STH1YIL126W 4080 nt2.65□□□□□ -1.99
MSN5P52918 UTP22YGR090W 3714 nt2.65□□□□□ -1.99
MSN5P52918 PKH2YOL100W 3246 nt2.64□□□□□ -1.99
MSN5P52918 UTP8YGR128C 2142 nt2.64□□□□□ -1.99
MSN5P52918 HMI1YOL095C 2121 nt2.64□□□□□ -1.99
MSN5P52918 GYP5YPL249C 2685 nt2.64□□□□□ -1.99
MSN5P52918 KRE33YNL132W 3171 nt2.63□□□□□ -1.99
MSN5P52918 YEF3YLR249W 3135 nt2.63□□□□□ -1.99
MSN5P52918 YLL020CYLL020C 306 nt2.62□□□□□ -1.99
MSN5P52918 YBL039C-AYBL039C-A 84 nt2.62□□□□□ -1.99
MSN5P52918 MDS3YGL197W 4464 nt2.61□□□□□ -1.99
MSN5P52918 MSH5YDL154W 2706 nt2.6□□□□□ -1.99
MSN5P52918 YAL037C-AYAL037C-A 93 nt2.6□□□□□ -1.99
MSN5P52918 TRS130YMR218C 3309 nt2.58□□□□□ -2
MSN5P52918 COG4YPR105C 2586 nt2.58□□□□□ -2
MSN5P52918 YOR343W-BYOR343W-B 5313 nt2.57□□□□□ -2
MSN5P52918 BFR2YDR299W 1605 nt2.57□□□□□ -2
MSN5P52918 GIP3YPL137C 3831 nt2.57□□□□□ -2
MSN5P52918 YGL123C-AYGL123C-A 231 nt2.56□□□□□ -2
MSN5P52918 VPS8YAL002W 3825 nt2.56□□□□□ -2
MSN5P52918 YMR175W-AYMR175W-A 195 nt2.56□□□□□ -2
MSN5P52918 UBR1YGR184C 5853 nt2.56□□□□□ -2
MSN5P52918 SAP185YJL098W 3177 nt2.56□□□□□ -2
MSN5P52918 VPS13YLL040C 9435 nt2.56□□□□□ -2
MSN5P52918 SVL3YPL032C 2478 nt2.56□□□□□ -2
MSN5P52918 BUD2YKL092C 3315 nt2.55□□□□□ -2
MSN5P52918 RPS29AYLR388W 171 nt2.55□□□□□ -2
MSN5P52918 FAR11YNL127W 2862 nt2.55□□□□□ -2
MSN5P52918 CHC1YGL206C 4962 nt2.54□□□□□ -2
MSN5P52918 SLI15YBR156C 2097 nt2.54□□□□□ -2
MSN5P52918 AGC1YPR021C 2709 nt2.54□□□□□ -2
MSN5P52918 RPL37BYDR500C 267 nt2.54□□□□□ -2
MSN5P52918 MET18YIL128W 3099 nt2.54□□□□□ -2
MSN5P52918 YDL206WYDL206W 2289 nt2.53□□□□□ -2
MSN5P52918 SLX4YLR135W 2247 nt2.53□□□□□ -2
MSN5P52918 IST2YBR086C 2841 nt2.52□□□□□ -2.01
MSN5P52918 TAH1YCR060W 336 nt2.52□□□□□ -2.01
MSN5P52918 UFD2YDL190C 2886 nt2.51□□□□□ -2.01
MSN5P52918 RTT107YHR154W 3213 nt2.51□□□□□ -2.01
MSN5P52918 PDR8YLR266C 2106 nt2.51□□□□□ -2.01
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