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Protein–RNA interactions for Protein: P52918
MSN5, Protein MSN5, yeast
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1,224 aa
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Protein
RNA
Prediction (catRAPID)
Interaction (RIP-Chip)
Gene
UniProt Accession
Gene
Ensembl Transcript ID
Length
Transcript Status
Prediction Score
Prediction z-Score
Detected Interaction
MSN5
P52918
SMC6
YLR383W
3345 nt
2.84
□□□□□ -1.96
MSN5
P52918
ZIP1
YDR285W
2628 nt
2.83
□□□□□ -1.96
MSN5
P52918
PTP2
YOR208W
2253 nt
2.83
□□□□□ -1.96
MSN5
P52918
HSH155
YMR288W
2916 nt
2.83
□□□□□ -1.96
MSN5
P52918
NOP14
YDL148C
2433 nt
2.83
□□□□□ -1.96
MSN5
P52918
MSB1
YOR188W
3414 nt
2.83
□□□□□ -1.96
MSN5
P52918
ESL2
YKR096W
3588 nt
2.82
□□□□□ -1.96
MSN5
P52918
CDC53
YDL132W
2448 nt
2.82
□□□□□ -1.96
MSN5
P52918
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YLL054C
2532 nt
2.82
□□□□□ -1.96
MSN5
P52918
SCD5
YOR329C
2619 nt
2.82
□□□□□ -1.96
MSN5
P52918
ESC1
YMR219W
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□□□□□ -1.96
MSN5
P52918
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YCR102W-A
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□□□□□ -1.96
MSN5
P52918
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YGR271W
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□□□□□ -1.96
MSN5
P52918
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YIL002W-A
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2.8
□□□□□ -1.96
MSN5
P52918
SRO77
YBL106C
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2.8
□□□□□ -1.96
MSN5
P52918
ENV11
YGR071C
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□□□□□ -1.96
MSN5
P52918
RCO1
YMR075W
2055 nt
2.8
□□□□□ -1.96
MSN5
P52918
IFH1
YLR223C
3258 nt
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□□□□□ -1.96
MSN5
P52918
SSN2
YDR443C
4263 nt
2.78
□□□□□ -1.96
MSN5
P52918
DCP2
YNL118C
2913 nt
2.78
□□□□□ -1.96
MSN5
P52918
YJL026C-A
YJL026C-A
222 nt
2.78
□□□□□ -1.96
MSN5
P52918
YOR055W
YOR055W
435 nt
2.78
□□□□□ -1.96
MSN5
P52918
GEA1
YJR031C
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2.77
□□□□□ -1.97
MSN5
P52918
YAL067W-A
YAL067W-A
228 nt
2.77
□□□□□ -1.97
MSN5
P52918
APL2
YKL135C
2181 nt
2.77
□□□□□ -1.97
MSN5
P52918
SGM1
YJR134C
2124 nt
2.77
□□□□□ -1.97
MSN5
P52918
YDR521W
YDR521W
336 nt
2.76
□□□□□ -1.97
MSN5
P52918
TTI1
YKL033W
3117 nt
2.76
□□□□□ -1.97
MSN5
P52918
SAP190
YKR028W
3102 nt
2.76
□□□□□ -1.97
MSN5
P52918
INP51
YIL002C
2841 nt
2.76
□□□□□ -1.97
MSN5
P52918
IRC8
YJL051W
2469 nt
2.76
□□□□□ -1.97
MSN5
P52918
NUP100
YKL068W
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2.75
□□□□□ -1.97
MSN5
P52918
YGL182C
YGL182C
324 nt
2.75
□□□□□ -1.97
MSN5
P52918
QCR9
YGR183C
201 nt
2.75
□□□□□ -1.97
MSN5
P52918
CBF2
YGR140W
2871 nt
2.75
□□□□□ -1.97
MSN5
P52918
ISW1
YBR245C
3390 nt
2.74
□□□□□ -1.97
MSN5
P52918
ALK1
YGL021W
2283 nt
2.74
□□□□□ -1.97
MSN5
P52918
snR81
snR81
201 nt
2.74
□□□□□ -1.97
MSN5
P52918
YHR131W-A
YHR131W-A
246 nt
2.74
□□□□□ -1.97
MSN5
P52918
SIR4
YDR227W
4077 nt
2.73
□□□□□ -1.97
MSN5
P52918
TOR1
YJR066W
7413 nt
2.73
□□□□□ -1.97
MSN5
P52918
MMS22
YLR320W
4365 nt
2.71
□□□□□ -1.98
MSN5
P52918
YKR075W-A
YKR075W-A
270 nt
2.71
□□□□□ -1.98
MSN5
P52918
YNL018C
YNL018C
1839 nt
2.7
□□□□□ -1.98
MSN5
P52918
LHS1
YKL073W
2646 nt
2.7
□□□□□ -1.98
MSN5
P52918
SEC63
YOR254C
1992 nt
2.7
□□□□□ -1.98
MSN5
P52918
STB6
YKL072W
2301 nt
2.7
□□□□□ -1.98
MSN5
P52918
BNR1
YIL159W
4128 nt
2.7
□□□□□ -1.98
MSN5
P52918
YGR109W-B
YGR109W-B
4644 nt
2.69
□□□□□ -1.98
MSN5
P52918
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YLR035C-A
3468 nt
2.69
□□□□□ -1.98
MSN5
P52918
snR39B
snR39B
96 nt
2.69
□□□□□ -1.98
MSN5
P52918
MLH1
YMR167W
2310 nt
2.68
□□□□□ -1.98
MSN5
P52918
PSD2
YGR170W
3417 nt
2.68
□□□□□ -1.98
MSN5
P52918
MAK10
YEL053C
2202 nt
2.68
□□□□□ -1.98
MSN5
P52918
APL1
YJR005W
2103 nt
2.67
□□□□□ -1.98
MSN5
P52918
MRD1
YPR112C
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2.67
□□□□□ -1.98
MSN5
P52918
MLH3
YPL164C
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2.66
□□□□□ -1.98
MSN5
P52918
TOP2
YNL088W
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2.66
□□□□□ -1.98
MSN5
P52918
AMS1
YGL156W
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□□□□□ -1.99
MSN5
P52918
snR62
snR62
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MSN5
P52918
STH1
YIL126W
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MSN5
P52918
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YGR090W
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MSN5
P52918
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YOL100W
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MSN5
P52918
UTP8
YGR128C
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MSN5
P52918
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YOL095C
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2.64
□□□□□ -1.99
MSN5
P52918
GYP5
YPL249C
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□□□□□ -1.99
MSN5
P52918
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YNL132W
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MSN5
P52918
YEF3
YLR249W
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MSN5
P52918
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YLL020C
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□□□□□ -1.99
MSN5
P52918
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YBL039C-A
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2.62
□□□□□ -1.99
MSN5
P52918
MDS3
YGL197W
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□□□□□ -1.99
MSN5
P52918
MSH5
YDL154W
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□□□□□ -1.99
MSN5
P52918
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YAL037C-A
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2.6
□□□□□ -1.99
MSN5
P52918
TRS130
YMR218C
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□□□□□ -2
MSN5
P52918
COG4
YPR105C
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2.58
□□□□□ -2
MSN5
P52918
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YOR343W-B
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2.57
□□□□□ -2
MSN5
P52918
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MSN5
P52918
GIP3
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MSN5
P52918
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YGL123C-A
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2.56
□□□□□ -2
MSN5
P52918
VPS8
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2.56
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MSN5
P52918
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YMR175W-A
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2.56
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MSN5
P52918
UBR1
YGR184C
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MSN5
P52918
SAP185
YJL098W
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2.56
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MSN5
P52918
VPS13
YLL040C
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□□□□□ -2
MSN5
P52918
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MSN5
P52918
BUD2
YKL092C
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MSN5
P52918
RPS29A
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MSN5
P52918
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YNL127W
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MSN5
P52918
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MSN5
P52918
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YBR156C
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MSN5
P52918
AGC1
YPR021C
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MSN5
P52918
RPL37B
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MSN5
P52918
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MSN5
P52918
YDL206W
YDL206W
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2.53
□□□□□ -2
MSN5
P52918
SLX4
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2.53
□□□□□ -2
MSN5
P52918
IST2
YBR086C
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□□□□□ -2.01
MSN5
P52918
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YCR060W
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2.52
□□□□□ -2.01
MSN5
P52918
UFD2
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2.51
□□□□□ -2.01
MSN5
P52918
RTT107
YHR154W
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2.51
□□□□□ -2.01
MSN5
P52918
PDR8
YLR266C
2106 nt
2.51
□□□□□ -2.01
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