Protein–RNA interactions for Protein: P46100

ATRX, Transcriptional regulator ATRX, humanhuman

Predictions only

Length 2,492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRXP46100 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATRXP46100 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATRXP46100 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATRXP46100 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATRXP46100 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATRXP46100 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATRXP46100 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATRXP46100 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATRXP46100 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATRXP46100 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATRXP46100 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATRXP46100 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATRXP46100 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATRXP46100 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATRXP46100 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATRXP46100 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATRXP46100 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATRXP46100 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATRXP46100 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATRXP46100 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATRXP46100 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATRXP46100 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATRXP46100 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATRXP46100 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATRXP46100 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATRXP46100 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATRXP46100 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATRXP46100 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATRXP46100 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ATRXP46100 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATRXP46100 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ATRXP46100 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ATRXP46100 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATRXP46100 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATRXP46100 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATRXP46100 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATRXP46100 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ATRXP46100 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATRXP46100 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATRXP46100 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATRXP46100 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ATRXP46100 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATRXP46100 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATRXP46100 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ATRXP46100 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ATRXP46100 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATRXP46100 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATRXP46100 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATRXP46100 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATRXP46100 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATRXP46100 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATRXP46100 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATRXP46100 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ATRXP46100 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATRXP46100 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATRXP46100 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATRXP46100 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATRXP46100 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATRXP46100 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATRXP46100 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATRXP46100 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATRXP46100 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATRXP46100 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ATRXP46100 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ATRXP46100 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATRXP46100 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATRXP46100 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATRXP46100 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATRXP46100 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATRXP46100 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
ATRXP46100 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATRXP46100 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATRXP46100 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATRXP46100 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATRXP46100 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATRXP46100 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATRXP46100 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
ATRXP46100 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATRXP46100 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATRXP46100 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATRXP46100 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATRXP46100 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATRXP46100 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATRXP46100 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATRXP46100 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATRXP46100 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATRXP46100 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATRXP46100 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
ATRXP46100 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATRXP46100 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATRXP46100 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATRXP46100 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATRXP46100 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATRXP46100 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATRXP46100 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATRXP46100 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATRXP46100 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATRXP46100 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATRXP46100 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATRXP46100 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms