Protein–RNA interactions for Protein: P43354

NR4A2, Nuclear receptor subfamily 4 group A member 2, humanhuman

Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR4A2P43354 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NR4A2P43354 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NR4A2P43354 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NR4A2P43354 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NR4A2P43354 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NR4A2P43354 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NR4A2P43354 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NR4A2P43354 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NR4A2P43354 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NR4A2P43354 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
NR4A2P43354 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NR4A2P43354 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NR4A2P43354 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NR4A2P43354 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NR4A2P43354 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NR4A2P43354 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NR4A2P43354 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NR4A2P43354 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NR4A2P43354 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NR4A2P43354 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
NR4A2P43354 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NR4A2P43354 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NR4A2P43354 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NR4A2P43354 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NR4A2P43354 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NR4A2P43354 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NR4A2P43354 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NR4A2P43354 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NR4A2P43354 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NR4A2P43354 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NR4A2P43354 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NR4A2P43354 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
NR4A2P43354 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NR4A2P43354 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NR4A2P43354 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NR4A2P43354 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NR4A2P43354 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NR4A2P43354 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NR4A2P43354 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NR4A2P43354 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NR4A2P43354 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NR4A2P43354 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NR4A2P43354 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NR4A2P43354 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NR4A2P43354 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NR4A2P43354 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NR4A2P43354 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NR4A2P43354 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NR4A2P43354 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NR4A2P43354 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NR4A2P43354 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NR4A2P43354 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
NR4A2P43354 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NR4A2P43354 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NR4A2P43354 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NR4A2P43354 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NR4A2P43354 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NR4A2P43354 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NR4A2P43354 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NR4A2P43354 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NR4A2P43354 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NR4A2P43354 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NR4A2P43354 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NR4A2P43354 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
NR4A2P43354 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NR4A2P43354 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NR4A2P43354 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NR4A2P43354 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NR4A2P43354 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NR4A2P43354 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
NR4A2P43354 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NR4A2P43354 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NR4A2P43354 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NR4A2P43354 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
NR4A2P43354 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NR4A2P43354 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NR4A2P43354 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NR4A2P43354 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NR4A2P43354 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NR4A2P43354 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NR4A2P43354 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NR4A2P43354 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NR4A2P43354 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NR4A2P43354 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NR4A2P43354 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NR4A2P43354 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NR4A2P43354 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NR4A2P43354 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NR4A2P43354 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NR4A2P43354 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NR4A2P43354 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NR4A2P43354 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NR4A2P43354 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NR4A2P43354 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NR4A2P43354 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NR4A2P43354 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NR4A2P43354 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NR4A2P43354 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NR4A2P43354 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NR4A2P43354 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms