Protein–RNA interactions for Protein: P42858

HTT, Huntingtin, humanhuman

Predictions only

Length 3,142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTTP42858 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HTTP42858 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HTTP42858 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
HTTP42858 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HTTP42858 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HTTP42858 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HTTP42858 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HTTP42858 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HTTP42858 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HTTP42858 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HTTP42858 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HTTP42858 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HTTP42858 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HTTP42858 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HTTP42858 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HTTP42858 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
HTTP42858 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HTTP42858 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HTTP42858 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
HTTP42858 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HTTP42858 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HTTP42858 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HTTP42858 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HTTP42858 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HTTP42858 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HTTP42858 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HTTP42858 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
HTTP42858 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HTTP42858 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
HTTP42858 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HTTP42858 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HTTP42858 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HTTP42858 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HTTP42858 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HTTP42858 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HTTP42858 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HTTP42858 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HTTP42858 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HTTP42858 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
HTTP42858 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
HTTP42858 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
HTTP42858 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HTTP42858 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HTTP42858 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HTTP42858 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HTTP42858 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
HTTP42858 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HTTP42858 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HTTP42858 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HTTP42858 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HTTP42858 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HTTP42858 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HTTP42858 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HTTP42858 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HTTP42858 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HTTP42858 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HTTP42858 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HTTP42858 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HTTP42858 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HTTP42858 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HTTP42858 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HTTP42858 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
HTTP42858 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
HTTP42858 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HTTP42858 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HTTP42858 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
HTTP42858 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
HTTP42858 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HTTP42858 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HTTP42858 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HTTP42858 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
HTTP42858 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HTTP42858 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HTTP42858 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HTTP42858 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HTTP42858 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HTTP42858 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
HTTP42858 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HTTP42858 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HTTP42858 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HTTP42858 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HTTP42858 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HTTP42858 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HTTP42858 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HTTP42858 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HTTP42858 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HTTP42858 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HTTP42858 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HTTP42858 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HTTP42858 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HTTP42858 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HTTP42858 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HTTP42858 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HTTP42858 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HTTP42858 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HTTP42858 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
HTTP42858 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HTTP42858 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HTTP42858 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HTTP42858 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms