Protein–RNA interactions for Protein: P42766

RPL35, 60S ribosomal protein L35, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL35P42766 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RPL35P42766 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RPL35P42766 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RPL35P42766 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RPL35P42766 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RPL35P42766 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RPL35P42766 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RPL35P42766 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RPL35P42766 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RPL35P42766 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RPL35P42766 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RPL35P42766 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RPL35P42766 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RPL35P42766 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RPL35P42766 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RPL35P42766 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RPL35P42766 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RPL35P42766 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
RPL35P42766 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
RPL35P42766 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RPL35P42766 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RPL35P42766 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RPL35P42766 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RPL35P42766 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RPL35P42766 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RPL35P42766 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RPL35P42766 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RPL35P42766 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RPL35P42766 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RPL35P42766 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RPL35P42766 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RPL35P42766 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RPL35P42766 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RPL35P42766 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RPL35P42766 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RPL35P42766 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RPL35P42766 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RPL35P42766 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RPL35P42766 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RPL35P42766 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RPL35P42766 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RPL35P42766 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RPL35P42766 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RPL35P42766 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RPL35P42766 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RPL35P42766 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RPL35P42766 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RPL35P42766 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RPL35P42766 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RPL35P42766 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RPL35P42766 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RPL35P42766 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RPL35P42766 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RPL35P42766 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RPL35P42766 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RPL35P42766 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RPL35P42766 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RPL35P42766 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RPL35P42766 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RPL35P42766 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RPL35P42766 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RPL35P42766 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RPL35P42766 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RPL35P42766 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RPL35P42766 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
RPL35P42766 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
RPL35P42766 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RPL35P42766 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RPL35P42766 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RPL35P42766 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RPL35P42766 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RPL35P42766 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RPL35P42766 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RPL35P42766 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RPL35P42766 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RPL35P42766 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RPL35P42766 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RPL35P42766 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RPL35P42766 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RPL35P42766 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RPL35P42766 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RPL35P42766 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RPL35P42766 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RPL35P42766 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RPL35P42766 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RPL35P42766 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RPL35P42766 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RPL35P42766 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RPL35P42766 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RPL35P42766 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RPL35P42766 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RPL35P42766 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RPL35P42766 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
RPL35P42766 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RPL35P42766 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RPL35P42766 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
RPL35P42766 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RPL35P42766 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RPL35P42766 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RPL35P42766 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms