Protein–RNA interactions for Protein: P38788

SSZ1, Ribosome-associated complex subunit SSZ1, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 538 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SSZ1P38788 YOR376WYOR376W 369 nt1.96□□□□□ -2.1
SSZ1P38788 FAB1YFR019W 6837 nt1.95□□□□□ -2.1
SSZ1P38788 YHR210CYHR210C 1026 nt1.95□□□□□ -2.1
SSZ1P38788 YLR294CYLR294C 330 nt1.95□□□□□ -2.1
SSZ1P38788 YBL008W-AYBL008W-A 240 nt1.95□□□□□ -2.1
SSZ1P38788 YBR174CYBR174C 315 nt1.95□□□□□ -2.1
SSZ1P38788 NAB6YML117W 3405 nt1.95□□□□□ -2.1
SSZ1P38788 ATG9YDL149W 2994 nt1.95□□□□□ -2.1
SSZ1P38788 SFB2YNL049C 2631 nt1.94□□□□□ -2.1
SSZ1P38788 YGR151CYGR151C 336 nt1.94□□□□□ -2.1
SSZ1P38788 tT(UGU)HtT(UGU)H 72 nt1.94□□□□□ -2.1
SSZ1P38788 TMA7YLR262C-A 195 nt1.94□□□□□ -2.1
SSZ1P38788 YMR175W-AYMR175W-A 195 nt1.94□□□□□ -2.1
SSZ1P38788 UTP21YLR409C 2820 nt1.94□□□□□ -2.1
SSZ1P38788 YOR072W-BYOR072W-B 162 nt1.93□□□□□ -2.1
SSZ1P38788 LHS1YKL073W 2646 nt1.93□□□□□ -2.1
SSZ1P38788 MGA2YIR033W 3342 nt1.92□□□□□ -2.1
SSZ1P38788 YMR247W-AYMR247W-A 144 nt1.92□□□□□ -2.1
SSZ1P38788 SIR4YDR227W 4077 nt1.92□□□□□ -2.1
SSZ1P38788 APL5YPL195W 2799 nt1.92□□□□□ -2.1
SSZ1P38788 ECM12YHR021W-A 456 nt1.91□□□□□ -2.1
SSZ1P38788 PBY1YBR094W 2262 nt1.91□□□□□ -2.1
SSZ1P38788 SLI15YBR156C 2097 nt1.9□□□□□ -2.1
SSZ1P38788 UBR2YLR024C 5619 nt1.9□□□□□ -2.1
SSZ1P38788 PKH2YOL100W 3246 nt1.9□□□□□ -2.11
SSZ1P38788 TDA9YML081W 3756 nt1.89□□□□□ -2.11
SSZ1P38788 IRC20YLR247C 4671 nt1.89□□□□□ -2.11
SSZ1P38788 YER172C-AYER172C-A 381 nt1.89□□□□□ -2.11
SSZ1P38788 COF1YLL050C 432 nt1.89□□□□□ -2.11
SSZ1P38788 YBR131C-AYBR131C-A 90 nt1.89□□□□□ -2.11
SSZ1P38788 ALK1YGL021W 2283 nt1.89□□□□□ -2.11
SSZ1P38788 VPS15YBR097W 4365 nt1.89□□□□□ -2.11
SSZ1P38788 ATG11YPR049C 3537 nt1.89□□□□□ -2.11
SSZ1P38788 COG4YPR105C 2586 nt1.89□□□□□ -2.11
SSZ1P38788 PEP1YBL017C 4740 nt1.89□□□□□ -2.11
SSZ1P38788 PIP2YOR363C 2991 nt1.89□□□□□ -2.11
SSZ1P38788 PAU3YCR104W 375 nt1.88□□□□□ -2.11
SSZ1P38788 ULI1YFR026C 510 nt1.88□□□□□ -2.11
SSZ1P38788 YGL217CYGL217C 342 nt1.88□□□□□ -2.11
SSZ1P38788 SPO24YPR036W-A 204 nt1.88□□□□□ -2.11
SSZ1P38788 YJR039WYJR039W 3366 nt1.88□□□□□ -2.11
SSZ1P38788 YLR035C-AYLR035C-A 3468 nt1.86□□□□□ -2.11
SSZ1P38788 AHC1YOR023C 1701 nt1.86□□□□□ -2.11
SSZ1P38788 YDR521WYDR521W 336 nt1.86□□□□□ -2.11
SSZ1P38788 YJL150WYJL150W 303 nt1.86□□□□□ -2.11
SSZ1P38788 YNL097C-BYNL097C-B 123 nt1.86□□□□□ -2.11
SSZ1P38788 YLR140WYLR140W 327 nt1.85□□□□□ -2.11
SSZ1P38788 YLL019W-AYLL019W-A 93 nt1.84□□□□□ -2.11
SSZ1P38788 YLR342W-AYLR342W-A 174 nt1.84□□□□□ -2.11
SSZ1P38788 RAD50YNL250W 3939 nt1.84□□□□□ -2.12
SSZ1P38788 AIM44YPL158C 2277 nt1.84□□□□□ -2.12
SSZ1P38788 YLR419WYLR419W 4308 nt1.83□□□□□ -2.12
SSZ1P38788 EMC5YIL027C 426 nt1.83□□□□□ -2.12
SSZ1P38788 MON2YNL297C 4911 nt1.83□□□□□ -2.12
SSZ1P38788 NCA2YPR155C 1851 nt1.82□□□□□ -2.12
SSZ1P38788 YNL338WYNL338W 159 nt1.82□□□□□ -2.12
SSZ1P38788 YBR206WYBR206W 324 nt1.82□□□□□ -2.12
SSZ1P38788 SLD3YGL113W 2007 nt1.82□□□□□ -2.12
SSZ1P38788 ADR1YDR216W 3972 nt1.82□□□□□ -2.12
SSZ1P38788 SBE22YHR103W 2559 nt1.82□□□□□ -2.12
SSZ1P38788 YDL196WYDL196W 330 nt1.81□□□□□ -2.12
SSZ1P38788 IRA1YBR140C 9279 nt1.81□□□□□ -2.12
SSZ1P38788 MEC1YBR136W 7107 nt1.81□□□□□ -2.12
SSZ1P38788 FIG4YNL325C 2640 nt1.81□□□□□ -2.12
SSZ1P38788 IFH1YLR223C 3258 nt1.81□□□□□ -2.12
SSZ1P38788 RTP1YMR185W 2946 nt1.8□□□□□ -2.12
SSZ1P38788 PRP39YML046W 1890 nt1.8□□□□□ -2.12
SSZ1P38788 YOR345CYOR345C 351 nt1.8□□□□□ -2.12
SSZ1P38788 snR46snR46 197 nt1.79□□□□□ -2.12
SSZ1P38788 snR52snR52 92 nt1.79□□□□□ -2.12
SSZ1P38788 TRS65YGR166W 1683 nt1.79□□□□□ -2.12
SSZ1P38788 NUT1YGL151W 3399 nt1.78□□□□□ -2.13
SSZ1P38788 UFD2YDL190C 2886 nt1.77□□□□□ -2.13
SSZ1P38788 KIP1YBL063W 3336 nt1.77□□□□□ -2.13
SSZ1P38788 SKI3YPR189W 4299 nt1.77□□□□□ -2.13
SSZ1P38788 GYP5YPL249C 2685 nt1.77□□□□□ -2.13
SSZ1P38788 YDL206WYDL206W 2289 nt1.77□□□□□ -2.13
SSZ1P38788 TBS1YBR150C 3285 nt1.76□□□□□ -2.13
SSZ1P38788 YGR109W-BYGR109W-B 4644 nt1.76□□□□□ -2.13
SSZ1P38788 SMC4YLR086W 4257 nt1.76□□□□□ -2.13
SSZ1P38788 SLX4YLR135W 2247 nt1.76□□□□□ -2.13
SSZ1P38788 PKH3YDR466W 2697 nt1.75□□□□□ -2.13
SSZ1P38788 YLL054CYLL054C 2532 nt1.75□□□□□ -2.13
SSZ1P38788 CTF4YPR135W 2784 nt1.74□□□□□ -2.13
SSZ1P38788 MMS4YBR098W 2076 nt1.73□□□□□ -2.13
SSZ1P38788 YDR354C-AYDR354C-A 144 nt1.73□□□□□ -2.13
SSZ1P38788 RPL33BYOR234C 324 nt1.73□□□□□ -2.13
SSZ1P38788 YJL022WYJL022W 309 nt1.72□□□□□ -2.13
SSZ1P38788 TRM3YDL112W 4311 nt1.71□□□□□ -2.14
SSZ1P38788 DNF3YMR162C 4971 nt1.7□□□□□ -2.14
SSZ1P38788 ALY2YJL084C 3141 nt1.7□□□□□ -2.14
SSZ1P38788 YPP1YGR198W 2454 nt1.69□□□□□ -2.14
SSZ1P38788 snR14snR14 160 nt1.69□□□□□ -2.14
SSZ1P38788 SMC1YFL008W 3678 nt1.69□□□□□ -2.14
SSZ1P38788 YEL073CYEL073C 324 nt1.68□□□□□ -2.14
SSZ1P38788 YOR093CYOR093C 4947 nt1.68□□□□□ -2.14
SSZ1P38788 APL1YJR005W 2103 nt1.67□□□□□ -2.14
SSZ1P38788 PAN2YGL094C 3348 nt1.67□□□□□ -2.14
SSZ1P38788 MDS3YGL197W 4464 nt1.67□□□□□ -2.14
SSZ1P38788 COY1YKL179C 2040 nt1.66□□□□□ -2.14
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