Protein–RNA interactions for Protein: P36954

POLR2I, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2IP36954 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
POLR2IP36954 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
POLR2IP36954 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
POLR2IP36954 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
POLR2IP36954 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
POLR2IP36954 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
POLR2IP36954 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
POLR2IP36954 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
POLR2IP36954 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
POLR2IP36954 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
POLR2IP36954 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
POLR2IP36954 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
POLR2IP36954 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
POLR2IP36954 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
POLR2IP36954 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
POLR2IP36954 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
POLR2IP36954 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
POLR2IP36954 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
POLR2IP36954 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
POLR2IP36954 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
POLR2IP36954 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
POLR2IP36954 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
POLR2IP36954 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
POLR2IP36954 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
POLR2IP36954 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
POLR2IP36954 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
POLR2IP36954 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
POLR2IP36954 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
POLR2IP36954 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
POLR2IP36954 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
POLR2IP36954 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
POLR2IP36954 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
POLR2IP36954 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
POLR2IP36954 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
POLR2IP36954 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
POLR2IP36954 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
POLR2IP36954 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
POLR2IP36954 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
POLR2IP36954 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
POLR2IP36954 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
POLR2IP36954 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
POLR2IP36954 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
POLR2IP36954 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
POLR2IP36954 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
POLR2IP36954 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
POLR2IP36954 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
POLR2IP36954 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
POLR2IP36954 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
POLR2IP36954 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
POLR2IP36954 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
POLR2IP36954 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
POLR2IP36954 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
POLR2IP36954 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
POLR2IP36954 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
POLR2IP36954 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
POLR2IP36954 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
POLR2IP36954 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
POLR2IP36954 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
POLR2IP36954 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
POLR2IP36954 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
POLR2IP36954 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
POLR2IP36954 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
POLR2IP36954 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
POLR2IP36954 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
POLR2IP36954 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
POLR2IP36954 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
POLR2IP36954 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
POLR2IP36954 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
POLR2IP36954 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
POLR2IP36954 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
POLR2IP36954 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
POLR2IP36954 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
POLR2IP36954 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
POLR2IP36954 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
POLR2IP36954 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
POLR2IP36954 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
POLR2IP36954 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
POLR2IP36954 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
POLR2IP36954 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
POLR2IP36954 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
POLR2IP36954 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
POLR2IP36954 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
POLR2IP36954 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
POLR2IP36954 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
POLR2IP36954 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
POLR2IP36954 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
POLR2IP36954 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
POLR2IP36954 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
POLR2IP36954 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
POLR2IP36954 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
POLR2IP36954 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
POLR2IP36954 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
POLR2IP36954 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
POLR2IP36954 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
POLR2IP36954 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
POLR2IP36954 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
POLR2IP36954 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
POLR2IP36954 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
POLR2IP36954 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
POLR2IP36954 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.4 ms