Protein–RNA interactions for Protein: P35670

ATP7B, Copper-transporting ATPase 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP7BP35670 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ATP7BP35670 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ATP7BP35670 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ATP7BP35670 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ATP7BP35670 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ATP7BP35670 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
ATP7BP35670 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
ATP7BP35670 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
ATP7BP35670 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC27.66■■■□□ 2.02
ATP7BP35670 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
ATP7BP35670 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
ATP7BP35670 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ATP7BP35670 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
ATP7BP35670 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
ATP7BP35670 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ATP7BP35670 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
ATP7BP35670 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ATP7BP35670 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ATP7BP35670 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ATP7BP35670 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ATP7BP35670 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ATP7BP35670 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ATP7BP35670 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ATP7BP35670 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ATP7BP35670 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ATP7BP35670 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ATP7BP35670 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ATP7BP35670 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
ATP7BP35670 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
ATP7BP35670 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
ATP7BP35670 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
ATP7BP35670 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
ATP7BP35670 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
ATP7BP35670 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC27.64■■■□□ 2.02
ATP7BP35670 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
ATP7BP35670 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
ATP7BP35670 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
ATP7BP35670 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
ATP7BP35670 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
ATP7BP35670 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
ATP7BP35670 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
ATP7BP35670 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
ATP7BP35670 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
ATP7BP35670 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
ATP7BP35670 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC27.64■■■□□ 2.01
ATP7BP35670 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ATP7BP35670 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ATP7BP35670 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ATP7BP35670 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ATP7BP35670 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ATP7BP35670 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ATP7BP35670 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ATP7BP35670 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ATP7BP35670 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ATP7BP35670 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ATP7BP35670 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ATP7BP35670 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ATP7BP35670 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ATP7BP35670 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ATP7BP35670 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ATP7BP35670 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ATP7BP35670 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ATP7BP35670 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ATP7BP35670 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ATP7BP35670 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ATP7BP35670 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ATP7BP35670 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ATP7BP35670 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ATP7BP35670 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ATP7BP35670 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ATP7BP35670 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ATP7BP35670 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ATP7BP35670 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ATP7BP35670 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ATP7BP35670 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ATP7BP35670 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
ATP7BP35670 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ATP7BP35670 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
ATP7BP35670 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
ATP7BP35670 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ATP7BP35670 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ATP7BP35670 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ATP7BP35670 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ATP7BP35670 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ATP7BP35670 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ATP7BP35670 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ATP7BP35670 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ATP7BP35670 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
ATP7BP35670 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ATP7BP35670 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ATP7BP35670 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ATP7BP35670 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ATP7BP35670 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ATP7BP35670 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ATP7BP35670 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ATP7BP35670 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ATP7BP35670 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ATP7BP35670 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ATP7BP35670 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ATP7BP35670 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms