Protein–RNA interactions for Protein: P29973

CNGA1, cGMP-gated cation channel alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA1P29973 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CNGA1P29973 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CNGA1P29973 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CNGA1P29973 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CNGA1P29973 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CNGA1P29973 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CNGA1P29973 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CNGA1P29973 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CNGA1P29973 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CNGA1P29973 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CNGA1P29973 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CNGA1P29973 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CNGA1P29973 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CNGA1P29973 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CNGA1P29973 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CNGA1P29973 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CNGA1P29973 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CNGA1P29973 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CNGA1P29973 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CNGA1P29973 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CNGA1P29973 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CNGA1P29973 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CNGA1P29973 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CNGA1P29973 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CNGA1P29973 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CNGA1P29973 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CNGA1P29973 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CNGA1P29973 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CNGA1P29973 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CNGA1P29973 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CNGA1P29973 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CNGA1P29973 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CNGA1P29973 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CNGA1P29973 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CNGA1P29973 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CNGA1P29973 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CNGA1P29973 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CNGA1P29973 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CNGA1P29973 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CNGA1P29973 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CNGA1P29973 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CNGA1P29973 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CNGA1P29973 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CNGA1P29973 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CNGA1P29973 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CNGA1P29973 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CNGA1P29973 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CNGA1P29973 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CNGA1P29973 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CNGA1P29973 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CNGA1P29973 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CNGA1P29973 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CNGA1P29973 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CNGA1P29973 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CNGA1P29973 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CNGA1P29973 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CNGA1P29973 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CNGA1P29973 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CNGA1P29973 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CNGA1P29973 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CNGA1P29973 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CNGA1P29973 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CNGA1P29973 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CNGA1P29973 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CNGA1P29973 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CNGA1P29973 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CNGA1P29973 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CNGA1P29973 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CNGA1P29973 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CNGA1P29973 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CNGA1P29973 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CNGA1P29973 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CNGA1P29973 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CNGA1P29973 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CNGA1P29973 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CNGA1P29973 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CNGA1P29973 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CNGA1P29973 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CNGA1P29973 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CNGA1P29973 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CNGA1P29973 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CNGA1P29973 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CNGA1P29973 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CNGA1P29973 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CNGA1P29973 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CNGA1P29973 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CNGA1P29973 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CNGA1P29973 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CNGA1P29973 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CNGA1P29973 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CNGA1P29973 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CNGA1P29973 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CNGA1P29973 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CNGA1P29973 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CNGA1P29973 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CNGA1P29973 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CNGA1P29973 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CNGA1P29973 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CNGA1P29973 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CNGA1P29973 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.2 ms