Protein–RNA interactions for Protein: P23434

GCSH, Glycine cleavage system H protein, mitochondrial, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCSHP23434 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
GCSHP23434 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
GCSHP23434 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
GCSHP23434 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
GCSHP23434 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
GCSHP23434 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
GCSHP23434 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
GCSHP23434 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
GCSHP23434 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
GCSHP23434 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
GCSHP23434 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
GCSHP23434 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
GCSHP23434 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
GCSHP23434 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
GCSHP23434 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
GCSHP23434 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
GCSHP23434 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
GCSHP23434 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
GCSHP23434 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
GCSHP23434 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
GCSHP23434 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
GCSHP23434 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
GCSHP23434 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
GCSHP23434 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
GCSHP23434 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
GCSHP23434 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
GCSHP23434 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
GCSHP23434 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
GCSHP23434 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
GCSHP23434 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
GCSHP23434 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
GCSHP23434 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
GCSHP23434 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
GCSHP23434 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
GCSHP23434 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
GCSHP23434 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
GCSHP23434 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
GCSHP23434 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
GCSHP23434 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
GCSHP23434 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
GCSHP23434 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
GCSHP23434 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
GCSHP23434 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
GCSHP23434 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
GCSHP23434 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
GCSHP23434 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
GCSHP23434 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
GCSHP23434 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
GCSHP23434 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
GCSHP23434 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
GCSHP23434 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
GCSHP23434 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
GCSHP23434 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
GCSHP23434 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
GCSHP23434 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
GCSHP23434 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
GCSHP23434 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
GCSHP23434 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
GCSHP23434 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
GCSHP23434 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
GCSHP23434 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
GCSHP23434 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
GCSHP23434 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
GCSHP23434 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
GCSHP23434 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
GCSHP23434 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
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GCSHP23434 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
GCSHP23434 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
GCSHP23434 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
GCSHP23434 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
GCSHP23434 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
GCSHP23434 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
GCSHP23434 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
GCSHP23434 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
GCSHP23434 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
GCSHP23434 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
GCSHP23434 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
GCSHP23434 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
GCSHP23434 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
GCSHP23434 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
GCSHP23434 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
GCSHP23434 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
GCSHP23434 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
GCSHP23434 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
GCSHP23434 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
GCSHP23434 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
GCSHP23434 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
GCSHP23434 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
GCSHP23434 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.08
GCSHP23434 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
GCSHP23434 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
GCSHP23434 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
GCSHP23434 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
GCSHP23434 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
GCSHP23434 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
GCSHP23434 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
GCSHP23434 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
GCSHP23434 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
GCSHP23434 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
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