Protein–RNA interactions for Protein: P23229

ITGA6, Integrin alpha-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA6P23229 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ITGA6P23229 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ITGA6P23229 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
ITGA6P23229 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ITGA6P23229 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ITGA6P23229 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ITGA6P23229 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ITGA6P23229 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ITGA6P23229 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ITGA6P23229 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ITGA6P23229 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ITGA6P23229 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ITGA6P23229 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ITGA6P23229 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ITGA6P23229 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ITGA6P23229 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ITGA6P23229 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ITGA6P23229 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ITGA6P23229 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ITGA6P23229 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ITGA6P23229 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
ITGA6P23229 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
ITGA6P23229 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ITGA6P23229 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ITGA6P23229 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ITGA6P23229 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ITGA6P23229 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
ITGA6P23229 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ITGA6P23229 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
ITGA6P23229 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ITGA6P23229 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ITGA6P23229 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
ITGA6P23229 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ITGA6P23229 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ITGA6P23229 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
ITGA6P23229 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ITGA6P23229 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ITGA6P23229 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ITGA6P23229 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ITGA6P23229 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ITGA6P23229 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ITGA6P23229 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ITGA6P23229 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ITGA6P23229 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ITGA6P23229 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ITGA6P23229 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
ITGA6P23229 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ITGA6P23229 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ITGA6P23229 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ITGA6P23229 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ITGA6P23229 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ITGA6P23229 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ITGA6P23229 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ITGA6P23229 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ITGA6P23229 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ITGA6P23229 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ITGA6P23229 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ITGA6P23229 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ITGA6P23229 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ITGA6P23229 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ITGA6P23229 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ITGA6P23229 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ITGA6P23229 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ITGA6P23229 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ITGA6P23229 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ITGA6P23229 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ITGA6P23229 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ITGA6P23229 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ITGA6P23229 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ITGA6P23229 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ITGA6P23229 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ITGA6P23229 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ITGA6P23229 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ITGA6P23229 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ITGA6P23229 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ITGA6P23229 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ITGA6P23229 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ITGA6P23229 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ITGA6P23229 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ITGA6P23229 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ITGA6P23229 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ITGA6P23229 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ITGA6P23229 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ITGA6P23229 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ITGA6P23229 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ITGA6P23229 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ITGA6P23229 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ITGA6P23229 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ITGA6P23229 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ITGA6P23229 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ITGA6P23229 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ITGA6P23229 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ITGA6P23229 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ITGA6P23229 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ITGA6P23229 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ITGA6P23229 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ITGA6P23229 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
ITGA6P23229 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ITGA6P23229 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ITGA6P23229 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms