Protein–RNA interactions for Protein: P22415

USF1, Upstream stimulatory factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF1P22415 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
USF1P22415 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
USF1P22415 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
USF1P22415 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
USF1P22415 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
USF1P22415 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
USF1P22415 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
USF1P22415 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
USF1P22415 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
USF1P22415 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
USF1P22415 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
USF1P22415 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
USF1P22415 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
USF1P22415 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
USF1P22415 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
USF1P22415 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
USF1P22415 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
USF1P22415 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
USF1P22415 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
USF1P22415 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
USF1P22415 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
USF1P22415 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
USF1P22415 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
USF1P22415 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
USF1P22415 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
USF1P22415 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
USF1P22415 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
USF1P22415 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
USF1P22415 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
USF1P22415 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
USF1P22415 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
USF1P22415 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
USF1P22415 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
USF1P22415 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
USF1P22415 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
USF1P22415 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
USF1P22415 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
USF1P22415 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
USF1P22415 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
USF1P22415 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
USF1P22415 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
USF1P22415 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
USF1P22415 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
USF1P22415 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
USF1P22415 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
USF1P22415 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
USF1P22415 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
USF1P22415 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
USF1P22415 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
USF1P22415 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
USF1P22415 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
USF1P22415 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
USF1P22415 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
USF1P22415 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
USF1P22415 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
USF1P22415 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
USF1P22415 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
USF1P22415 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
USF1P22415 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
USF1P22415 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
USF1P22415 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
USF1P22415 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
USF1P22415 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
USF1P22415 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
USF1P22415 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
USF1P22415 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
USF1P22415 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
USF1P22415 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
USF1P22415 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
USF1P22415 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
USF1P22415 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
USF1P22415 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
USF1P22415 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
USF1P22415 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
USF1P22415 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
USF1P22415 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
USF1P22415 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
USF1P22415 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
USF1P22415 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
USF1P22415 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
USF1P22415 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
USF1P22415 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
USF1P22415 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
USF1P22415 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
USF1P22415 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
USF1P22415 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
USF1P22415 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
USF1P22415 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
USF1P22415 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
USF1P22415 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
USF1P22415 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
USF1P22415 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
USF1P22415 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
USF1P22415 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.3
USF1P22415 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
USF1P22415 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
USF1P22415 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
USF1P22415 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
USF1P22415 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
USF1P22415 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms