Protein–RNA interactions for Protein: P16220

CREB1, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB1P16220 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CREB1P16220 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CREB1P16220 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CREB1P16220 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CREB1P16220 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CREB1P16220 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CREB1P16220 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CREB1P16220 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CREB1P16220 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CREB1P16220 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CREB1P16220 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CREB1P16220 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CREB1P16220 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CREB1P16220 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CREB1P16220 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CREB1P16220 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CREB1P16220 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CREB1P16220 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CREB1P16220 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CREB1P16220 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CREB1P16220 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CREB1P16220 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CREB1P16220 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CREB1P16220 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CREB1P16220 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CREB1P16220 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CREB1P16220 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CREB1P16220 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CREB1P16220 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CREB1P16220 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CREB1P16220 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CREB1P16220 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CREB1P16220 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CREB1P16220 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CREB1P16220 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CREB1P16220 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CREB1P16220 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CREB1P16220 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CREB1P16220 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CREB1P16220 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CREB1P16220 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CREB1P16220 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CREB1P16220 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CREB1P16220 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CREB1P16220 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CREB1P16220 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CREB1P16220 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CREB1P16220 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CREB1P16220 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CREB1P16220 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CREB1P16220 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CREB1P16220 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CREB1P16220 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
CREB1P16220 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CREB1P16220 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CREB1P16220 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CREB1P16220 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CREB1P16220 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CREB1P16220 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CREB1P16220 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CREB1P16220 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CREB1P16220 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CREB1P16220 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CREB1P16220 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CREB1P16220 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CREB1P16220 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CREB1P16220 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CREB1P16220 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CREB1P16220 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CREB1P16220 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CREB1P16220 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CREB1P16220 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CREB1P16220 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CREB1P16220 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CREB1P16220 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CREB1P16220 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CREB1P16220 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CREB1P16220 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CREB1P16220 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CREB1P16220 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CREB1P16220 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CREB1P16220 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CREB1P16220 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CREB1P16220 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CREB1P16220 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CREB1P16220 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
CREB1P16220 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CREB1P16220 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CREB1P16220 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CREB1P16220 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CREB1P16220 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CREB1P16220 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CREB1P16220 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CREB1P16220 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CREB1P16220 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CREB1P16220 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CREB1P16220 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CREB1P16220 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CREB1P16220 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CREB1P16220 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.6 ms