Protein–RNA interactions for Protein: P13637

ATP1A3, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,013 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A3P13637 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP1A3P13637 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP1A3P13637 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP1A3P13637 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP1A3P13637 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP1A3P13637 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP1A3P13637 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP1A3P13637 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP1A3P13637 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP1A3P13637 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP1A3P13637 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP1A3P13637 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP1A3P13637 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP1A3P13637 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP1A3P13637 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP1A3P13637 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP1A3P13637 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP1A3P13637 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP1A3P13637 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP1A3P13637 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP1A3P13637 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP1A3P13637 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP1A3P13637 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP1A3P13637 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP1A3P13637 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP1A3P13637 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP1A3P13637 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP1A3P13637 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP1A3P13637 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP1A3P13637 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP1A3P13637 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP1A3P13637 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP1A3P13637 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP1A3P13637 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP1A3P13637 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP1A3P13637 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP1A3P13637 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP1A3P13637 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP1A3P13637 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP1A3P13637 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP1A3P13637 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP1A3P13637 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP1A3P13637 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP1A3P13637 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP1A3P13637 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP1A3P13637 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP1A3P13637 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP1A3P13637 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP1A3P13637 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP1A3P13637 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP1A3P13637 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP1A3P13637 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP1A3P13637 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP1A3P13637 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP1A3P13637 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP1A3P13637 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP1A3P13637 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP1A3P13637 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP1A3P13637 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP1A3P13637 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP1A3P13637 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP1A3P13637 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP1A3P13637 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP1A3P13637 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP1A3P13637 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP1A3P13637 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP1A3P13637 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP1A3P13637 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP1A3P13637 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP1A3P13637 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP1A3P13637 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP1A3P13637 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP1A3P13637 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP1A3P13637 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP1A3P13637 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP1A3P13637 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP1A3P13637 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP1A3P13637 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP1A3P13637 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP1A3P13637 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP1A3P13637 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP1A3P13637 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP1A3P13637 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP1A3P13637 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP1A3P13637 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP1A3P13637 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP1A3P13637 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP1A3P13637 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATP1A3P13637 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATP1A3P13637 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATP1A3P13637 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATP1A3P13637 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATP1A3P13637 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATP1A3P13637 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATP1A3P13637 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATP1A3P13637 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATP1A3P13637 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATP1A3P13637 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATP1A3P13637 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
ATP1A3P13637 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms