Protein–RNA interactions for Protein: P13164

IFITM1, Interferon-induced transmembrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFITM1P13164 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
IFITM1P13164 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
IFITM1P13164 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
IFITM1P13164 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
IFITM1P13164 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
IFITM1P13164 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
IFITM1P13164 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
IFITM1P13164 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
IFITM1P13164 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
IFITM1P13164 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
IFITM1P13164 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
IFITM1P13164 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
IFITM1P13164 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
IFITM1P13164 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
IFITM1P13164 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
IFITM1P13164 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
IFITM1P13164 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
IFITM1P13164 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
IFITM1P13164 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
IFITM1P13164 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
IFITM1P13164 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
IFITM1P13164 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
IFITM1P13164 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
IFITM1P13164 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
IFITM1P13164 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
IFITM1P13164 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
IFITM1P13164 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
IFITM1P13164 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
IFITM1P13164 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
IFITM1P13164 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
IFITM1P13164 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
IFITM1P13164 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
IFITM1P13164 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
IFITM1P13164 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
IFITM1P13164 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
IFITM1P13164 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
IFITM1P13164 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
IFITM1P13164 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
IFITM1P13164 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
IFITM1P13164 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
IFITM1P13164 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
IFITM1P13164 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
IFITM1P13164 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
IFITM1P13164 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
IFITM1P13164 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
IFITM1P13164 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
IFITM1P13164 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
IFITM1P13164 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
IFITM1P13164 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
IFITM1P13164 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
IFITM1P13164 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
IFITM1P13164 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
IFITM1P13164 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
IFITM1P13164 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
IFITM1P13164 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
IFITM1P13164 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
IFITM1P13164 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
IFITM1P13164 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
IFITM1P13164 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
IFITM1P13164 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
IFITM1P13164 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
IFITM1P13164 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
IFITM1P13164 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
IFITM1P13164 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
IFITM1P13164 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
IFITM1P13164 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
IFITM1P13164 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
IFITM1P13164 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
IFITM1P13164 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
IFITM1P13164 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
IFITM1P13164 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
IFITM1P13164 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
IFITM1P13164 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
IFITM1P13164 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
IFITM1P13164 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
IFITM1P13164 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
IFITM1P13164 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
IFITM1P13164 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
IFITM1P13164 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
IFITM1P13164 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
IFITM1P13164 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
IFITM1P13164 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
IFITM1P13164 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
IFITM1P13164 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
IFITM1P13164 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
IFITM1P13164 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
IFITM1P13164 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
IFITM1P13164 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
IFITM1P13164 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
IFITM1P13164 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
IFITM1P13164 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
IFITM1P13164 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
IFITM1P13164 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
IFITM1P13164 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
IFITM1P13164 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
IFITM1P13164 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
IFITM1P13164 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
IFITM1P13164 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
IFITM1P13164 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
IFITM1P13164 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms