Protein–RNA interactions for Protein: P12980

LYL1, Protein lyl-1, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYL1P12980 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LYL1P12980 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LYL1P12980 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LYL1P12980 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LYL1P12980 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LYL1P12980 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LYL1P12980 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LYL1P12980 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LYL1P12980 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LYL1P12980 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
LYL1P12980 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LYL1P12980 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LYL1P12980 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LYL1P12980 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LYL1P12980 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LYL1P12980 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LYL1P12980 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LYL1P12980 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LYL1P12980 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LYL1P12980 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
LYL1P12980 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LYL1P12980 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LYL1P12980 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LYL1P12980 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LYL1P12980 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LYL1P12980 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LYL1P12980 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LYL1P12980 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LYL1P12980 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LYL1P12980 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LYL1P12980 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LYL1P12980 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LYL1P12980 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LYL1P12980 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LYL1P12980 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LYL1P12980 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LYL1P12980 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LYL1P12980 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LYL1P12980 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LYL1P12980 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LYL1P12980 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LYL1P12980 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LYL1P12980 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LYL1P12980 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LYL1P12980 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LYL1P12980 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LYL1P12980 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LYL1P12980 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LYL1P12980 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LYL1P12980 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
LYL1P12980 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LYL1P12980 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
LYL1P12980 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
LYL1P12980 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
LYL1P12980 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LYL1P12980 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LYL1P12980 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LYL1P12980 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LYL1P12980 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LYL1P12980 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LYL1P12980 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LYL1P12980 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LYL1P12980 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
LYL1P12980 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LYL1P12980 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LYL1P12980 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LYL1P12980 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LYL1P12980 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LYL1P12980 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LYL1P12980 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LYL1P12980 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LYL1P12980 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LYL1P12980 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LYL1P12980 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LYL1P12980 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
LYL1P12980 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LYL1P12980 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LYL1P12980 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LYL1P12980 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LYL1P12980 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LYL1P12980 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
LYL1P12980 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LYL1P12980 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LYL1P12980 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LYL1P12980 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LYL1P12980 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LYL1P12980 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LYL1P12980 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LYL1P12980 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LYL1P12980 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LYL1P12980 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LYL1P12980 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LYL1P12980 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LYL1P12980 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LYL1P12980 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
LYL1P12980 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LYL1P12980 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LYL1P12980 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LYL1P12980 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LYL1P12980 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.6 ms