Protein–RNA interactions for Protein: P10071

GLI3, Transcriptional activator GLI3, humanhuman

Predictions only

Length 1,580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI3P10071 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
GLI3P10071 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
GLI3P10071 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
GLI3P10071 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
GLI3P10071 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
GLI3P10071 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
GLI3P10071 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
GLI3P10071 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
GLI3P10071 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
GLI3P10071 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
GLI3P10071 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
GLI3P10071 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
GLI3P10071 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
GLI3P10071 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
GLI3P10071 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
GLI3P10071 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
GLI3P10071 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
GLI3P10071 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
GLI3P10071 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
GLI3P10071 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
GLI3P10071 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
GLI3P10071 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
GLI3P10071 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
GLI3P10071 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
GLI3P10071 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
GLI3P10071 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
GLI3P10071 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
GLI3P10071 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
GLI3P10071 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
GLI3P10071 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
GLI3P10071 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
GLI3P10071 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
GLI3P10071 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
GLI3P10071 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
GLI3P10071 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
GLI3P10071 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
GLI3P10071 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
GLI3P10071 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
GLI3P10071 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
GLI3P10071 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
GLI3P10071 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
GLI3P10071 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
GLI3P10071 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
GLI3P10071 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
GLI3P10071 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
GLI3P10071 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
GLI3P10071 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
GLI3P10071 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
GLI3P10071 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
GLI3P10071 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
GLI3P10071 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
GLI3P10071 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
GLI3P10071 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
GLI3P10071 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
GLI3P10071 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
GLI3P10071 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
GLI3P10071 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
GLI3P10071 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
GLI3P10071 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
GLI3P10071 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
GLI3P10071 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
GLI3P10071 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
GLI3P10071 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
GLI3P10071 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
GLI3P10071 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
GLI3P10071 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
GLI3P10071 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
GLI3P10071 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
GLI3P10071 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
GLI3P10071 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
GLI3P10071 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
GLI3P10071 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
GLI3P10071 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
GLI3P10071 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
GLI3P10071 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
GLI3P10071 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
GLI3P10071 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
GLI3P10071 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
GLI3P10071 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
GLI3P10071 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
GLI3P10071 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
GLI3P10071 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
GLI3P10071 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
GLI3P10071 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
GLI3P10071 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
GLI3P10071 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
GLI3P10071 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
GLI3P10071 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
GLI3P10071 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
GLI3P10071 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
GLI3P10071 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
GLI3P10071 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
GLI3P10071 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
GLI3P10071 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
GLI3P10071 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
GLI3P10071 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
GLI3P10071 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
GLI3P10071 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
GLI3P10071 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
GLI3P10071 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms