Protein–RNA interactions for Protein: P0C7I6

CCDC159, Coiled-coil domain-containing protein 159, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC159P0C7I6 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC159P0C7I6 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC159P0C7I6 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC159P0C7I6 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC159P0C7I6 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC159P0C7I6 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC159P0C7I6 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC159P0C7I6 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC159P0C7I6 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC159P0C7I6 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC159P0C7I6 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC159P0C7I6 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC159P0C7I6 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC159P0C7I6 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC159P0C7I6 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC159P0C7I6 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC159P0C7I6 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC159P0C7I6 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC159P0C7I6 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC159P0C7I6 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC159P0C7I6 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC159P0C7I6 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC159P0C7I6 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC159P0C7I6 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC159P0C7I6 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC159P0C7I6 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC159P0C7I6 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC159P0C7I6 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC159P0C7I6 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC159P0C7I6 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC159P0C7I6 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC159P0C7I6 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC159P0C7I6 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC159P0C7I6 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC159P0C7I6 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC159P0C7I6 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC159P0C7I6 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC159P0C7I6 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC159P0C7I6 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC159P0C7I6 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC159P0C7I6 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC159P0C7I6 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC159P0C7I6 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC159P0C7I6 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC159P0C7I6 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC159P0C7I6 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC159P0C7I6 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC159P0C7I6 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC159P0C7I6 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC159P0C7I6 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC159P0C7I6 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC159P0C7I6 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC159P0C7I6 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC159P0C7I6 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC159P0C7I6 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC159P0C7I6 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC159P0C7I6 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC159P0C7I6 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC159P0C7I6 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC159P0C7I6 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC159P0C7I6 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC159P0C7I6 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC159P0C7I6 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC159P0C7I6 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC159P0C7I6 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC159P0C7I6 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC159P0C7I6 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC159P0C7I6 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC159P0C7I6 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC159P0C7I6 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC159P0C7I6 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC159P0C7I6 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC159P0C7I6 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC159P0C7I6 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC159P0C7I6 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC159P0C7I6 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC159P0C7I6 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC159P0C7I6 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC159P0C7I6 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC159P0C7I6 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC159P0C7I6 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC159P0C7I6 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC159P0C7I6 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC159P0C7I6 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC159P0C7I6 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC159P0C7I6 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC159P0C7I6 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC159P0C7I6 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC159P0C7I6 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC159P0C7I6 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC159P0C7I6 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC159P0C7I6 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC159P0C7I6 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC159P0C7I6 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC159P0C7I6 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC159P0C7I6 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC159P0C7I6 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC159P0C7I6 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC159P0C7I6 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC159P0C7I6 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms