Protein–RNA interactions for Protein: P05014

IFNA4, Interferon alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNA4P05014 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
IFNA4P05014 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IFNA4P05014 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IFNA4P05014 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
IFNA4P05014 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IFNA4P05014 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
IFNA4P05014 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IFNA4P05014 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
IFNA4P05014 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
IFNA4P05014 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
IFNA4P05014 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
IFNA4P05014 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IFNA4P05014 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
IFNA4P05014 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IFNA4P05014 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IFNA4P05014 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IFNA4P05014 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
IFNA4P05014 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IFNA4P05014 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IFNA4P05014 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
IFNA4P05014 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
IFNA4P05014 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
IFNA4P05014 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
IFNA4P05014 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
IFNA4P05014 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
IFNA4P05014 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
IFNA4P05014 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
IFNA4P05014 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
IFNA4P05014 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
IFNA4P05014 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
IFNA4P05014 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
IFNA4P05014 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
IFNA4P05014 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
IFNA4P05014 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
IFNA4P05014 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
IFNA4P05014 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
IFNA4P05014 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
IFNA4P05014 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
IFNA4P05014 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
IFNA4P05014 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
IFNA4P05014 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
IFNA4P05014 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
IFNA4P05014 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
IFNA4P05014 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
IFNA4P05014 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
IFNA4P05014 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
IFNA4P05014 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
IFNA4P05014 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
IFNA4P05014 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
IFNA4P05014 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
IFNA4P05014 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
IFNA4P05014 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
IFNA4P05014 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
IFNA4P05014 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
IFNA4P05014 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
IFNA4P05014 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
IFNA4P05014 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
IFNA4P05014 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
IFNA4P05014 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
IFNA4P05014 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
IFNA4P05014 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
IFNA4P05014 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
IFNA4P05014 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
IFNA4P05014 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
IFNA4P05014 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
IFNA4P05014 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
IFNA4P05014 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
IFNA4P05014 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
IFNA4P05014 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
IFNA4P05014 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
IFNA4P05014 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
IFNA4P05014 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
IFNA4P05014 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
IFNA4P05014 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
IFNA4P05014 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
IFNA4P05014 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
IFNA4P05014 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
IFNA4P05014 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
IFNA4P05014 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
IFNA4P05014 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
IFNA4P05014 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
IFNA4P05014 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
IFNA4P05014 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
IFNA4P05014 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
IFNA4P05014 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
IFNA4P05014 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
IFNA4P05014 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
IFNA4P05014 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
IFNA4P05014 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
IFNA4P05014 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
IFNA4P05014 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
IFNA4P05014 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
IFNA4P05014 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
IFNA4P05014 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
IFNA4P05014 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
IFNA4P05014 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
IFNA4P05014 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
IFNA4P05014 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
IFNA4P05014 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
IFNA4P05014 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms