Protein–RNA interactions for Protein: P01602

IGKV1-5, Immunoglobulin kappa variable 1-5, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGKV1-5P01602 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
IGKV1-5P01602 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
IGKV1-5P01602 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
IGKV1-5P01602 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
IGKV1-5P01602 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
IGKV1-5P01602 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
IGKV1-5P01602 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
IGKV1-5P01602 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
IGKV1-5P01602 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
IGKV1-5P01602 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
IGKV1-5P01602 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
IGKV1-5P01602 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
IGKV1-5P01602 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
IGKV1-5P01602 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
IGKV1-5P01602 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
IGKV1-5P01602 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
IGKV1-5P01602 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
IGKV1-5P01602 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
IGKV1-5P01602 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
IGKV1-5P01602 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
IGKV1-5P01602 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
IGKV1-5P01602 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
IGKV1-5P01602 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
IGKV1-5P01602 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
IGKV1-5P01602 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
IGKV1-5P01602 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
IGKV1-5P01602 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
IGKV1-5P01602 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
IGKV1-5P01602 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
IGKV1-5P01602 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
IGKV1-5P01602 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
IGKV1-5P01602 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
IGKV1-5P01602 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
IGKV1-5P01602 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
IGKV1-5P01602 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
IGKV1-5P01602 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
IGKV1-5P01602 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
IGKV1-5P01602 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
IGKV1-5P01602 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
IGKV1-5P01602 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
IGKV1-5P01602 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
IGKV1-5P01602 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
IGKV1-5P01602 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IGKV1-5P01602 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IGKV1-5P01602 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IGKV1-5P01602 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IGKV1-5P01602 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IGKV1-5P01602 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
IGKV1-5P01602 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
IGKV1-5P01602 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IGKV1-5P01602 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
IGKV1-5P01602 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IGKV1-5P01602 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
IGKV1-5P01602 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
IGKV1-5P01602 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
IGKV1-5P01602 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
IGKV1-5P01602 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
IGKV1-5P01602 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IGKV1-5P01602 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
IGKV1-5P01602 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IGKV1-5P01602 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IGKV1-5P01602 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
IGKV1-5P01602 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
IGKV1-5P01602 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
IGKV1-5P01602 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
IGKV1-5P01602 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
IGKV1-5P01602 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
IGKV1-5P01602 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
IGKV1-5P01602 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
IGKV1-5P01602 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
IGKV1-5P01602 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
IGKV1-5P01602 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
IGKV1-5P01602 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
IGKV1-5P01602 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
IGKV1-5P01602 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
IGKV1-5P01602 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
IGKV1-5P01602 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
IGKV1-5P01602 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
IGKV1-5P01602 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
IGKV1-5P01602 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
IGKV1-5P01602 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
IGKV1-5P01602 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
IGKV1-5P01602 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
IGKV1-5P01602 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
IGKV1-5P01602 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
IGKV1-5P01602 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
IGKV1-5P01602 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
IGKV1-5P01602 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
IGKV1-5P01602 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
IGKV1-5P01602 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
IGKV1-5P01602 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
IGKV1-5P01602 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
IGKV1-5P01602 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
IGKV1-5P01602 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
IGKV1-5P01602 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
IGKV1-5P01602 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
IGKV1-5P01602 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
IGKV1-5P01602 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
IGKV1-5P01602 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
IGKV1-5P01602 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms