Protein–RNA interactions for Protein: O95602

POLR1A, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1AO95602 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
POLR1AO95602 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
POLR1AO95602 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
POLR1AO95602 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
POLR1AO95602 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
POLR1AO95602 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
POLR1AO95602 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
POLR1AO95602 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
POLR1AO95602 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
POLR1AO95602 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
POLR1AO95602 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
POLR1AO95602 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
POLR1AO95602 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
POLR1AO95602 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
POLR1AO95602 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
POLR1AO95602 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
POLR1AO95602 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
POLR1AO95602 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
POLR1AO95602 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
POLR1AO95602 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
POLR1AO95602 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
POLR1AO95602 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
POLR1AO95602 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
POLR1AO95602 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
POLR1AO95602 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
POLR1AO95602 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
POLR1AO95602 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
POLR1AO95602 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
POLR1AO95602 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
POLR1AO95602 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
POLR1AO95602 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
POLR1AO95602 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
POLR1AO95602 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC29.35■■■□□ 2.29
POLR1AO95602 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
POLR1AO95602 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
POLR1AO95602 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
POLR1AO95602 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
POLR1AO95602 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
POLR1AO95602 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
POLR1AO95602 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
POLR1AO95602 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
POLR1AO95602 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
POLR1AO95602 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
POLR1AO95602 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
POLR1AO95602 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
POLR1AO95602 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
POLR1AO95602 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
POLR1AO95602 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
POLR1AO95602 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
POLR1AO95602 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
POLR1AO95602 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
POLR1AO95602 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
POLR1AO95602 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
POLR1AO95602 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
POLR1AO95602 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
POLR1AO95602 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
POLR1AO95602 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
POLR1AO95602 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
POLR1AO95602 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
POLR1AO95602 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
POLR1AO95602 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
POLR1AO95602 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
POLR1AO95602 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
POLR1AO95602 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
POLR1AO95602 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
POLR1AO95602 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
POLR1AO95602 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
POLR1AO95602 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
POLR1AO95602 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
POLR1AO95602 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
POLR1AO95602 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
POLR1AO95602 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC29.32■■■□□ 2.28
POLR1AO95602 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
POLR1AO95602 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
POLR1AO95602 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
POLR1AO95602 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
POLR1AO95602 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
POLR1AO95602 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
POLR1AO95602 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
POLR1AO95602 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
POLR1AO95602 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
POLR1AO95602 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
POLR1AO95602 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC29.31■■■□□ 2.28
POLR1AO95602 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
POLR1AO95602 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
POLR1AO95602 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
POLR1AO95602 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
POLR1AO95602 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
POLR1AO95602 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
POLR1AO95602 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
POLR1AO95602 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
POLR1AO95602 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
POLR1AO95602 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
POLR1AO95602 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
POLR1AO95602 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
POLR1AO95602 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
POLR1AO95602 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
POLR1AO95602 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
POLR1AO95602 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
POLR1AO95602 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms