Protein–RNA interactions for Protein: O75323

NIPSNAP2, Protein NipSnap homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP2O75323 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NIPSNAP2O75323 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NIPSNAP2O75323 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NIPSNAP2O75323 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
NIPSNAP2O75323 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NIPSNAP2O75323 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
NIPSNAP2O75323 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
NIPSNAP2O75323 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
NIPSNAP2O75323 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
NIPSNAP2O75323 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NIPSNAP2O75323 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NIPSNAP2O75323 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NIPSNAP2O75323 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
NIPSNAP2O75323 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NIPSNAP2O75323 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
NIPSNAP2O75323 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NIPSNAP2O75323 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NIPSNAP2O75323 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NIPSNAP2O75323 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
NIPSNAP2O75323 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NIPSNAP2O75323 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NIPSNAP2O75323 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
NIPSNAP2O75323 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
NIPSNAP2O75323 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
NIPSNAP2O75323 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
NIPSNAP2O75323 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NIPSNAP2O75323 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NIPSNAP2O75323 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
NIPSNAP2O75323 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NIPSNAP2O75323 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NIPSNAP2O75323 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NIPSNAP2O75323 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NIPSNAP2O75323 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
NIPSNAP2O75323 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
NIPSNAP2O75323 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
NIPSNAP2O75323 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.77
NIPSNAP2O75323 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
NIPSNAP2O75323 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
NIPSNAP2O75323 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC19.83■□□□□ 0.77
NIPSNAP2O75323 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
NIPSNAP2O75323 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
NIPSNAP2O75323 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
NIPSNAP2O75323 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
NIPSNAP2O75323 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
NIPSNAP2O75323 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.76
NIPSNAP2O75323 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
NIPSNAP2O75323 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
NIPSNAP2O75323 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
NIPSNAP2O75323 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
NIPSNAP2O75323 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
NIPSNAP2O75323 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
NIPSNAP2O75323 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC19.83■□□□□ 0.76
NIPSNAP2O75323 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
NIPSNAP2O75323 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
NIPSNAP2O75323 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
NIPSNAP2O75323 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
NIPSNAP2O75323 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
NIPSNAP2O75323 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
NIPSNAP2O75323 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
NIPSNAP2O75323 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
NIPSNAP2O75323 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
NIPSNAP2O75323 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
NIPSNAP2O75323 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
NIPSNAP2O75323 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
NIPSNAP2O75323 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
NIPSNAP2O75323 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
NIPSNAP2O75323 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
NIPSNAP2O75323 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
NIPSNAP2O75323 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
NIPSNAP2O75323 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
NIPSNAP2O75323 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
NIPSNAP2O75323 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
NIPSNAP2O75323 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
NIPSNAP2O75323 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
NIPSNAP2O75323 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
NIPSNAP2O75323 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
NIPSNAP2O75323 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
NIPSNAP2O75323 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
NIPSNAP2O75323 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
NIPSNAP2O75323 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
NIPSNAP2O75323 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
NIPSNAP2O75323 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
NIPSNAP2O75323 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
NIPSNAP2O75323 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
NIPSNAP2O75323 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
NIPSNAP2O75323 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
NIPSNAP2O75323 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
NIPSNAP2O75323 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
NIPSNAP2O75323 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
NIPSNAP2O75323 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
NIPSNAP2O75323 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
NIPSNAP2O75323 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
NIPSNAP2O75323 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
NIPSNAP2O75323 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
NIPSNAP2O75323 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
NIPSNAP2O75323 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
NIPSNAP2O75323 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
NIPSNAP2O75323 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
NIPSNAP2O75323 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
NIPSNAP2O75323 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms