Protein–RNA interactions for Protein: O43395

PRPF3, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF3O43395 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRPF3O43395 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRPF3O43395 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRPF3O43395 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRPF3O43395 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRPF3O43395 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRPF3O43395 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRPF3O43395 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
PRPF3O43395 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRPF3O43395 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRPF3O43395 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRPF3O43395 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRPF3O43395 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRPF3O43395 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRPF3O43395 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRPF3O43395 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
PRPF3O43395 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRPF3O43395 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRPF3O43395 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRPF3O43395 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRPF3O43395 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRPF3O43395 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRPF3O43395 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRPF3O43395 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRPF3O43395 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRPF3O43395 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRPF3O43395 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRPF3O43395 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRPF3O43395 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRPF3O43395 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRPF3O43395 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRPF3O43395 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRPF3O43395 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRPF3O43395 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRPF3O43395 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRPF3O43395 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRPF3O43395 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRPF3O43395 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRPF3O43395 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRPF3O43395 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRPF3O43395 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRPF3O43395 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRPF3O43395 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRPF3O43395 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PRPF3O43395 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PRPF3O43395 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PRPF3O43395 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PRPF3O43395 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PRPF3O43395 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PRPF3O43395 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PRPF3O43395 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PRPF3O43395 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PRPF3O43395 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PRPF3O43395 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PRPF3O43395 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PRPF3O43395 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PRPF3O43395 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PRPF3O43395 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PRPF3O43395 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PRPF3O43395 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
PRPF3O43395 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PRPF3O43395 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PRPF3O43395 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PRPF3O43395 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRPF3O43395 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRPF3O43395 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRPF3O43395 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRPF3O43395 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRPF3O43395 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRPF3O43395 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRPF3O43395 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRPF3O43395 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRPF3O43395 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRPF3O43395 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRPF3O43395 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRPF3O43395 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRPF3O43395 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRPF3O43395 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRPF3O43395 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRPF3O43395 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRPF3O43395 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRPF3O43395 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
PRPF3O43395 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
PRPF3O43395 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRPF3O43395 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRPF3O43395 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRPF3O43395 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRPF3O43395 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRPF3O43395 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRPF3O43395 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRPF3O43395 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRPF3O43395 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRPF3O43395 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRPF3O43395 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRPF3O43395 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRPF3O43395 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRPF3O43395 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
PRPF3O43395 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRPF3O43395 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRPF3O43395 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms