Protein–RNA interactions for Protein: O43237

DYNC1LI2, Cytoplasmic dynein 1 light intermediate chain 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DYNC1LI2O43237 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
DYNC1LI2O43237 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
DYNC1LI2O43237 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DYNC1LI2O43237 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DYNC1LI2O43237 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
DYNC1LI2O43237 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
DYNC1LI2O43237 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DYNC1LI2O43237 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
DYNC1LI2O43237 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
DYNC1LI2O43237 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
DYNC1LI2O43237 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DYNC1LI2O43237 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DYNC1LI2O43237 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DYNC1LI2O43237 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DYNC1LI2O43237 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
DYNC1LI2O43237 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
DYNC1LI2O43237 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DYNC1LI2O43237 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DYNC1LI2O43237 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
DYNC1LI2O43237 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
DYNC1LI2O43237 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DYNC1LI2O43237 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DYNC1LI2O43237 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DYNC1LI2O43237 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DYNC1LI2O43237 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DYNC1LI2O43237 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
DYNC1LI2O43237 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
DYNC1LI2O43237 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DYNC1LI2O43237 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DYNC1LI2O43237 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DYNC1LI2O43237 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DYNC1LI2O43237 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DYNC1LI2O43237 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DYNC1LI2O43237 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DYNC1LI2O43237 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DYNC1LI2O43237 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DYNC1LI2O43237 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DYNC1LI2O43237 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DYNC1LI2O43237 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DYNC1LI2O43237 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DYNC1LI2O43237 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DYNC1LI2O43237 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DYNC1LI2O43237 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
DYNC1LI2O43237 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
DYNC1LI2O43237 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
DYNC1LI2O43237 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
DYNC1LI2O43237 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DYNC1LI2O43237 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DYNC1LI2O43237 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DYNC1LI2O43237 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
DYNC1LI2O43237 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
DYNC1LI2O43237 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
DYNC1LI2O43237 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
DYNC1LI2O43237 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
DYNC1LI2O43237 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
DYNC1LI2O43237 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
DYNC1LI2O43237 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
DYNC1LI2O43237 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DYNC1LI2O43237 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
DYNC1LI2O43237 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
DYNC1LI2O43237 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DYNC1LI2O43237 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DYNC1LI2O43237 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DYNC1LI2O43237 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DYNC1LI2O43237 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DYNC1LI2O43237 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DYNC1LI2O43237 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DYNC1LI2O43237 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DYNC1LI2O43237 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DYNC1LI2O43237 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DYNC1LI2O43237 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DYNC1LI2O43237 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DYNC1LI2O43237 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DYNC1LI2O43237 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DYNC1LI2O43237 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DYNC1LI2O43237 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DYNC1LI2O43237 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DYNC1LI2O43237 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DYNC1LI2O43237 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DYNC1LI2O43237 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DYNC1LI2O43237 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DYNC1LI2O43237 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DYNC1LI2O43237 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DYNC1LI2O43237 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DYNC1LI2O43237 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DYNC1LI2O43237 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DYNC1LI2O43237 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DYNC1LI2O43237 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DYNC1LI2O43237 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DYNC1LI2O43237 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DYNC1LI2O43237 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DYNC1LI2O43237 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DYNC1LI2O43237 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DYNC1LI2O43237 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DYNC1LI2O43237 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DYNC1LI2O43237 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DYNC1LI2O43237 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DYNC1LI2O43237 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DYNC1LI2O43237 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DYNC1LI2O43237 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms