Protein–RNA interactions for Protein: O15240

VGF, Neurosecretory protein VGF, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 615 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VGFO15240 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
VGFO15240 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
VGFO15240 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
VGFO15240 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
VGFO15240 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
VGFO15240 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
VGFO15240 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
VGFO15240 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
VGFO15240 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
VGFO15240 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
VGFO15240 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
VGFO15240 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
VGFO15240 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
VGFO15240 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
VGFO15240 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
VGFO15240 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
VGFO15240 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
VGFO15240 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
VGFO15240 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
VGFO15240 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
VGFO15240 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
VGFO15240 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
VGFO15240 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
VGFO15240 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
VGFO15240 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
VGFO15240 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
VGFO15240 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
VGFO15240 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
VGFO15240 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
VGFO15240 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.54■■■□□ 2.16
VGFO15240 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
VGFO15240 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
VGFO15240 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
VGFO15240 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
VGFO15240 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
VGFO15240 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
VGFO15240 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
VGFO15240 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
VGFO15240 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
VGFO15240 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
VGFO15240 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
VGFO15240 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
VGFO15240 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
VGFO15240 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
VGFO15240 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
VGFO15240 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
VGFO15240 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
VGFO15240 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
VGFO15240 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
VGFO15240 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
VGFO15240 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
VGFO15240 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
VGFO15240 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
VGFO15240 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
VGFO15240 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
VGFO15240 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
VGFO15240 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
VGFO15240 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC28.52■■■□□ 2.16
VGFO15240 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
VGFO15240 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
VGFO15240 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
VGFO15240 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
VGFO15240 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
VGFO15240 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.16
VGFO15240 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
VGFO15240 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
VGFO15240 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
VGFO15240 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
VGFO15240 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
VGFO15240 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC28.51■■■□□ 2.15
VGFO15240 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
VGFO15240 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
VGFO15240 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
VGFO15240 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
VGFO15240 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
VGFO15240 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
VGFO15240 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
VGFO15240 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
VGFO15240 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
VGFO15240 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
VGFO15240 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
VGFO15240 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
VGFO15240 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
VGFO15240 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
VGFO15240 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC28.5■■■□□ 2.15
VGFO15240 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
VGFO15240 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
VGFO15240 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
VGFO15240 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
VGFO15240 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
VGFO15240 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
VGFO15240 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
VGFO15240 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
VGFO15240 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
VGFO15240 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
VGFO15240 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
VGFO15240 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
VGFO15240 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
VGFO15240 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
VGFO15240 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
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