Protein–RNA interactions for Protein: O15047

SETD1A, Histone-lysine N-methyltransferase SETD1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETD1AO15047 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SETD1AO15047 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SETD1AO15047 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SETD1AO15047 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
SETD1AO15047 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SETD1AO15047 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SETD1AO15047 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SETD1AO15047 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SETD1AO15047 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SETD1AO15047 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SETD1AO15047 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SETD1AO15047 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SETD1AO15047 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SETD1AO15047 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SETD1AO15047 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SETD1AO15047 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
SETD1AO15047 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SETD1AO15047 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SETD1AO15047 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SETD1AO15047 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
SETD1AO15047 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SETD1AO15047 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SETD1AO15047 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
SETD1AO15047 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
SETD1AO15047 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SETD1AO15047 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SETD1AO15047 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SETD1AO15047 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SETD1AO15047 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SETD1AO15047 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SETD1AO15047 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SETD1AO15047 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SETD1AO15047 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SETD1AO15047 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SETD1AO15047 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SETD1AO15047 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SETD1AO15047 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SETD1AO15047 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
SETD1AO15047 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SETD1AO15047 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SETD1AO15047 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SETD1AO15047 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SETD1AO15047 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SETD1AO15047 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SETD1AO15047 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SETD1AO15047 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SETD1AO15047 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SETD1AO15047 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SETD1AO15047 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SETD1AO15047 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
SETD1AO15047 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SETD1AO15047 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SETD1AO15047 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SETD1AO15047 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SETD1AO15047 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SETD1AO15047 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SETD1AO15047 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SETD1AO15047 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SETD1AO15047 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SETD1AO15047 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SETD1AO15047 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SETD1AO15047 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SETD1AO15047 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SETD1AO15047 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SETD1AO15047 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SETD1AO15047 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SETD1AO15047 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SETD1AO15047 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SETD1AO15047 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SETD1AO15047 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SETD1AO15047 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SETD1AO15047 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SETD1AO15047 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SETD1AO15047 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SETD1AO15047 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SETD1AO15047 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SETD1AO15047 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SETD1AO15047 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
SETD1AO15047 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SETD1AO15047 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SETD1AO15047 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SETD1AO15047 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SETD1AO15047 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.12
SETD1AO15047 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
SETD1AO15047 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
SETD1AO15047 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.12
SETD1AO15047 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.12
SETD1AO15047 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.12
SETD1AO15047 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.12
SETD1AO15047 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
SETD1AO15047 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SETD1AO15047 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SETD1AO15047 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
SETD1AO15047 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
SETD1AO15047 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SETD1AO15047 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
SETD1AO15047 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
SETD1AO15047 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SETD1AO15047 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
SETD1AO15047 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms