Protein–RNA interactions for Protein: O14879

IFIT3, Interferon-induced protein with tetratricopeptide repeats 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFIT3O14879 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
IFIT3O14879 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
IFIT3O14879 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
IFIT3O14879 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
IFIT3O14879 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
IFIT3O14879 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
IFIT3O14879 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
IFIT3O14879 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
IFIT3O14879 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
IFIT3O14879 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
IFIT3O14879 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
IFIT3O14879 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
IFIT3O14879 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
IFIT3O14879 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
IFIT3O14879 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
IFIT3O14879 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
IFIT3O14879 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
IFIT3O14879 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
IFIT3O14879 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
IFIT3O14879 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
IFIT3O14879 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
IFIT3O14879 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
IFIT3O14879 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
IFIT3O14879 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
IFIT3O14879 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
IFIT3O14879 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
IFIT3O14879 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
IFIT3O14879 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
IFIT3O14879 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
IFIT3O14879 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
IFIT3O14879 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
IFIT3O14879 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
IFIT3O14879 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
IFIT3O14879 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
IFIT3O14879 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
IFIT3O14879 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
IFIT3O14879 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
IFIT3O14879 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
IFIT3O14879 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
IFIT3O14879 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
IFIT3O14879 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
IFIT3O14879 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
IFIT3O14879 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
IFIT3O14879 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
IFIT3O14879 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
IFIT3O14879 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
IFIT3O14879 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
IFIT3O14879 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
IFIT3O14879 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
IFIT3O14879 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
IFIT3O14879 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
IFIT3O14879 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
IFIT3O14879 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
IFIT3O14879 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
IFIT3O14879 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
IFIT3O14879 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
IFIT3O14879 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
IFIT3O14879 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
IFIT3O14879 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
IFIT3O14879 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
IFIT3O14879 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
IFIT3O14879 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
IFIT3O14879 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
IFIT3O14879 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
IFIT3O14879 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
IFIT3O14879 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
IFIT3O14879 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
IFIT3O14879 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
IFIT3O14879 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
IFIT3O14879 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
IFIT3O14879 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
IFIT3O14879 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
IFIT3O14879 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
IFIT3O14879 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
IFIT3O14879 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
IFIT3O14879 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
IFIT3O14879 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
IFIT3O14879 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
IFIT3O14879 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
IFIT3O14879 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
IFIT3O14879 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
IFIT3O14879 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
IFIT3O14879 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
IFIT3O14879 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
IFIT3O14879 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
IFIT3O14879 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
IFIT3O14879 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
IFIT3O14879 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
IFIT3O14879 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
IFIT3O14879 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
IFIT3O14879 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
IFIT3O14879 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
IFIT3O14879 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
IFIT3O14879 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
IFIT3O14879 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
IFIT3O14879 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
IFIT3O14879 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
IFIT3O14879 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
IFIT3O14879 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
IFIT3O14879 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms