Protein–RNA interactions for Protein: O14595

CTDSP2, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 2, humanhuman

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Length 271 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP2O14595 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CTDSP2O14595 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CTDSP2O14595 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CTDSP2O14595 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CTDSP2O14595 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CTDSP2O14595 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CTDSP2O14595 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CTDSP2O14595 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CTDSP2O14595 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CTDSP2O14595 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CTDSP2O14595 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CTDSP2O14595 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CTDSP2O14595 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CTDSP2O14595 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CTDSP2O14595 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CTDSP2O14595 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CTDSP2O14595 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CTDSP2O14595 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CTDSP2O14595 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CTDSP2O14595 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CTDSP2O14595 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CTDSP2O14595 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CTDSP2O14595 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CTDSP2O14595 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CTDSP2O14595 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CTDSP2O14595 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CTDSP2O14595 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CTDSP2O14595 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CTDSP2O14595 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CTDSP2O14595 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CTDSP2O14595 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CTDSP2O14595 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CTDSP2O14595 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CTDSP2O14595 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CTDSP2O14595 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CTDSP2O14595 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CTDSP2O14595 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CTDSP2O14595 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CTDSP2O14595 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CTDSP2O14595 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CTDSP2O14595 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CTDSP2O14595 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CTDSP2O14595 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CTDSP2O14595 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CTDSP2O14595 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CTDSP2O14595 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CTDSP2O14595 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CTDSP2O14595 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CTDSP2O14595 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CTDSP2O14595 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CTDSP2O14595 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CTDSP2O14595 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CTDSP2O14595 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CTDSP2O14595 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CTDSP2O14595 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CTDSP2O14595 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CTDSP2O14595 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CTDSP2O14595 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CTDSP2O14595 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CTDSP2O14595 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CTDSP2O14595 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CTDSP2O14595 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CTDSP2O14595 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CTDSP2O14595 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CTDSP2O14595 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CTDSP2O14595 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CTDSP2O14595 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CTDSP2O14595 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CTDSP2O14595 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CTDSP2O14595 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CTDSP2O14595 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CTDSP2O14595 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CTDSP2O14595 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CTDSP2O14595 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CTDSP2O14595 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CTDSP2O14595 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CTDSP2O14595 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CTDSP2O14595 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CTDSP2O14595 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
CTDSP2O14595 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CTDSP2O14595 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CTDSP2O14595 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CTDSP2O14595 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CTDSP2O14595 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CTDSP2O14595 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CTDSP2O14595 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
CTDSP2O14595 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
CTDSP2O14595 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
CTDSP2O14595 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CTDSP2O14595 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
CTDSP2O14595 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CTDSP2O14595 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CTDSP2O14595 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CTDSP2O14595 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CTDSP2O14595 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CTDSP2O14595 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CTDSP2O14595 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CTDSP2O14595 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CTDSP2O14595 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CTDSP2O14595 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
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