Protein–RNA interactions for Protein: A4D1S5

RAB19, Ras-related protein Rab-19, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB19A4D1S5 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB19A4D1S5 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB19A4D1S5 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB19A4D1S5 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB19A4D1S5 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB19A4D1S5 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB19A4D1S5 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB19A4D1S5 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB19A4D1S5 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB19A4D1S5 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB19A4D1S5 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB19A4D1S5 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB19A4D1S5 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB19A4D1S5 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB19A4D1S5 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB19A4D1S5 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB19A4D1S5 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB19A4D1S5 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB19A4D1S5 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB19A4D1S5 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB19A4D1S5 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB19A4D1S5 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB19A4D1S5 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB19A4D1S5 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB19A4D1S5 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB19A4D1S5 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB19A4D1S5 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB19A4D1S5 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB19A4D1S5 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB19A4D1S5 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB19A4D1S5 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB19A4D1S5 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB19A4D1S5 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB19A4D1S5 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB19A4D1S5 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB19A4D1S5 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB19A4D1S5 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB19A4D1S5 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB19A4D1S5 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB19A4D1S5 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB19A4D1S5 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB19A4D1S5 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB19A4D1S5 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB19A4D1S5 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB19A4D1S5 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB19A4D1S5 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB19A4D1S5 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
RAB19A4D1S5 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
RAB19A4D1S5 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB19A4D1S5 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB19A4D1S5 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB19A4D1S5 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB19A4D1S5 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB19A4D1S5 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB19A4D1S5 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB19A4D1S5 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB19A4D1S5 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB19A4D1S5 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB19A4D1S5 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB19A4D1S5 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB19A4D1S5 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB19A4D1S5 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB19A4D1S5 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB19A4D1S5 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB19A4D1S5 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB19A4D1S5 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB19A4D1S5 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB19A4D1S5 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB19A4D1S5 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB19A4D1S5 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB19A4D1S5 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB19A4D1S5 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB19A4D1S5 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB19A4D1S5 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB19A4D1S5 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB19A4D1S5 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB19A4D1S5 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB19A4D1S5 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB19A4D1S5 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB19A4D1S5 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB19A4D1S5 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB19A4D1S5 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB19A4D1S5 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB19A4D1S5 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB19A4D1S5 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB19A4D1S5 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB19A4D1S5 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB19A4D1S5 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB19A4D1S5 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB19A4D1S5 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB19A4D1S5 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB19A4D1S5 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB19A4D1S5 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB19A4D1S5 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB19A4D1S5 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB19A4D1S5 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB19A4D1S5 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB19A4D1S5 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB19A4D1S5 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB19A4D1S5 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms