Protein–RNA interactions for Protein: A4D0T7

SMIM30, Small integral membrane protein 30, humanhuman

Predictions only

Length 59 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM30A4D0T7 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SMIM30A4D0T7 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SMIM30A4D0T7 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SMIM30A4D0T7 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SMIM30A4D0T7 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SMIM30A4D0T7 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SMIM30A4D0T7 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SMIM30A4D0T7 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SMIM30A4D0T7 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SMIM30A4D0T7 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SMIM30A4D0T7 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SMIM30A4D0T7 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SMIM30A4D0T7 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SMIM30A4D0T7 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SMIM30A4D0T7 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SMIM30A4D0T7 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SMIM30A4D0T7 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SMIM30A4D0T7 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SMIM30A4D0T7 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SMIM30A4D0T7 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SMIM30A4D0T7 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SMIM30A4D0T7 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SMIM30A4D0T7 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SMIM30A4D0T7 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SMIM30A4D0T7 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
SMIM30A4D0T7 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SMIM30A4D0T7 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SMIM30A4D0T7 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SMIM30A4D0T7 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SMIM30A4D0T7 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SMIM30A4D0T7 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SMIM30A4D0T7 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SMIM30A4D0T7 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SMIM30A4D0T7 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SMIM30A4D0T7 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SMIM30A4D0T7 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SMIM30A4D0T7 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SMIM30A4D0T7 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SMIM30A4D0T7 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SMIM30A4D0T7 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SMIM30A4D0T7 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SMIM30A4D0T7 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SMIM30A4D0T7 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SMIM30A4D0T7 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SMIM30A4D0T7 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
SMIM30A4D0T7 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SMIM30A4D0T7 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SMIM30A4D0T7 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SMIM30A4D0T7 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SMIM30A4D0T7 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SMIM30A4D0T7 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
SMIM30A4D0T7 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
SMIM30A4D0T7 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SMIM30A4D0T7 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SMIM30A4D0T7 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SMIM30A4D0T7 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
SMIM30A4D0T7 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SMIM30A4D0T7 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SMIM30A4D0T7 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SMIM30A4D0T7 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SMIM30A4D0T7 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SMIM30A4D0T7 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
SMIM30A4D0T7 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SMIM30A4D0T7 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SMIM30A4D0T7 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
SMIM30A4D0T7 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SMIM30A4D0T7 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SMIM30A4D0T7 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SMIM30A4D0T7 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SMIM30A4D0T7 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SMIM30A4D0T7 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SMIM30A4D0T7 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SMIM30A4D0T7 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SMIM30A4D0T7 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SMIM30A4D0T7 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SMIM30A4D0T7 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SMIM30A4D0T7 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SMIM30A4D0T7 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SMIM30A4D0T7 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
SMIM30A4D0T7 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SMIM30A4D0T7 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SMIM30A4D0T7 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SMIM30A4D0T7 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SMIM30A4D0T7 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SMIM30A4D0T7 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SMIM30A4D0T7 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SMIM30A4D0T7 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SMIM30A4D0T7 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SMIM30A4D0T7 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SMIM30A4D0T7 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SMIM30A4D0T7 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SMIM30A4D0T7 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SMIM30A4D0T7 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SMIM30A4D0T7 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SMIM30A4D0T7 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
SMIM30A4D0T7 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SMIM30A4D0T7 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SMIM30A4D0T7 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SMIM30A4D0T7 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SMIM30A4D0T7 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms