Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5Q9

GTF3C3, General transcription factor 3C polypeptide 3, humanhuman

Predictions only

Length 886 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C3Q9Y5Q9 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
GTF3C3Q9Y5Q9 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
GTF3C3Q9Y5Q9 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
GTF3C3Q9Y5Q9 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
GTF3C3Q9Y5Q9 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
GTF3C3Q9Y5Q9 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
GTF3C3Q9Y5Q9 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
GTF3C3Q9Y5Q9 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
GTF3C3Q9Y5Q9 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
GTF3C3Q9Y5Q9 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
GTF3C3Q9Y5Q9 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
GTF3C3Q9Y5Q9 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
GTF3C3Q9Y5Q9 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
GTF3C3Q9Y5Q9 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
GTF3C3Q9Y5Q9 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
GTF3C3Q9Y5Q9 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
GTF3C3Q9Y5Q9 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.93■■□□□ 1.9
GTF3C3Q9Y5Q9 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
GTF3C3Q9Y5Q9 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
GTF3C3Q9Y5Q9 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
GTF3C3Q9Y5Q9 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
GTF3C3Q9Y5Q9 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
GTF3C3Q9Y5Q9 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
GTF3C3Q9Y5Q9 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
GTF3C3Q9Y5Q9 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
GTF3C3Q9Y5Q9 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
GTF3C3Q9Y5Q9 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
GTF3C3Q9Y5Q9 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
GTF3C3Q9Y5Q9 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
GTF3C3Q9Y5Q9 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
GTF3C3Q9Y5Q9 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
GTF3C3Q9Y5Q9 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
GTF3C3Q9Y5Q9 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
GTF3C3Q9Y5Q9 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
GTF3C3Q9Y5Q9 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
GTF3C3Q9Y5Q9 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
GTF3C3Q9Y5Q9 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
GTF3C3Q9Y5Q9 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
GTF3C3Q9Y5Q9 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
GTF3C3Q9Y5Q9 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
GTF3C3Q9Y5Q9 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
GTF3C3Q9Y5Q9 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
GTF3C3Q9Y5Q9 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
GTF3C3Q9Y5Q9 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
GTF3C3Q9Y5Q9 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
GTF3C3Q9Y5Q9 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
GTF3C3Q9Y5Q9 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
GTF3C3Q9Y5Q9 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
GTF3C3Q9Y5Q9 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
GTF3C3Q9Y5Q9 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
GTF3C3Q9Y5Q9 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
GTF3C3Q9Y5Q9 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
GTF3C3Q9Y5Q9 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
GTF3C3Q9Y5Q9 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
GTF3C3Q9Y5Q9 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
GTF3C3Q9Y5Q9 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
GTF3C3Q9Y5Q9 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
GTF3C3Q9Y5Q9 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
GTF3C3Q9Y5Q9 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
GTF3C3Q9Y5Q9 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
GTF3C3Q9Y5Q9 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
GTF3C3Q9Y5Q9 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
GTF3C3Q9Y5Q9 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
GTF3C3Q9Y5Q9 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
GTF3C3Q9Y5Q9 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
GTF3C3Q9Y5Q9 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
GTF3C3Q9Y5Q9 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
GTF3C3Q9Y5Q9 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
GTF3C3Q9Y5Q9 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
GTF3C3Q9Y5Q9 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
GTF3C3Q9Y5Q9 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
GTF3C3Q9Y5Q9 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
GTF3C3Q9Y5Q9 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
GTF3C3Q9Y5Q9 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
GTF3C3Q9Y5Q9 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
GTF3C3Q9Y5Q9 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
GTF3C3Q9Y5Q9 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
GTF3C3Q9Y5Q9 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
GTF3C3Q9Y5Q9 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
GTF3C3Q9Y5Q9 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
GTF3C3Q9Y5Q9 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
GTF3C3Q9Y5Q9 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
GTF3C3Q9Y5Q9 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
GTF3C3Q9Y5Q9 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
GTF3C3Q9Y5Q9 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC26.89■■□□□ 1.89
GTF3C3Q9Y5Q9 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
GTF3C3Q9Y5Q9 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
GTF3C3Q9Y5Q9 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
GTF3C3Q9Y5Q9 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
GTF3C3Q9Y5Q9 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
GTF3C3Q9Y5Q9 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
GTF3C3Q9Y5Q9 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
GTF3C3Q9Y5Q9 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
GTF3C3Q9Y5Q9 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
GTF3C3Q9Y5Q9 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
GTF3C3Q9Y5Q9 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
GTF3C3Q9Y5Q9 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
GTF3C3Q9Y5Q9 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
GTF3C3Q9Y5Q9 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
GTF3C3Q9Y5Q9 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms