Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y496

KIF3A, Kinesin-like protein KIF3A, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIF3AQ9Y496 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KIF3AQ9Y496 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KIF3AQ9Y496 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
KIF3AQ9Y496 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
KIF3AQ9Y496 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KIF3AQ9Y496 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KIF3AQ9Y496 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
KIF3AQ9Y496 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KIF3AQ9Y496 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KIF3AQ9Y496 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KIF3AQ9Y496 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KIF3AQ9Y496 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
KIF3AQ9Y496 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
KIF3AQ9Y496 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
KIF3AQ9Y496 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
KIF3AQ9Y496 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KIF3AQ9Y496 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
KIF3AQ9Y496 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
KIF3AQ9Y496 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KIF3AQ9Y496 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KIF3AQ9Y496 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
KIF3AQ9Y496 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KIF3AQ9Y496 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KIF3AQ9Y496 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
KIF3AQ9Y496 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
KIF3AQ9Y496 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KIF3AQ9Y496 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KIF3AQ9Y496 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
KIF3AQ9Y496 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KIF3AQ9Y496 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
KIF3AQ9Y496 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
KIF3AQ9Y496 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
KIF3AQ9Y496 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
KIF3AQ9Y496 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
KIF3AQ9Y496 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
KIF3AQ9Y496 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
KIF3AQ9Y496 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KIF3AQ9Y496 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
KIF3AQ9Y496 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KIF3AQ9Y496 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KIF3AQ9Y496 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KIF3AQ9Y496 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
KIF3AQ9Y496 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
KIF3AQ9Y496 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
KIF3AQ9Y496 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.35
KIF3AQ9Y496 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KIF3AQ9Y496 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KIF3AQ9Y496 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
KIF3AQ9Y496 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KIF3AQ9Y496 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KIF3AQ9Y496 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
KIF3AQ9Y496 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
KIF3AQ9Y496 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
KIF3AQ9Y496 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
KIF3AQ9Y496 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
KIF3AQ9Y496 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KIF3AQ9Y496 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KIF3AQ9Y496 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
KIF3AQ9Y496 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
KIF3AQ9Y496 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
KIF3AQ9Y496 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
KIF3AQ9Y496 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
KIF3AQ9Y496 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
KIF3AQ9Y496 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KIF3AQ9Y496 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
KIF3AQ9Y496 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KIF3AQ9Y496 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
KIF3AQ9Y496 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
KIF3AQ9Y496 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
KIF3AQ9Y496 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KIF3AQ9Y496 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
KIF3AQ9Y496 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KIF3AQ9Y496 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KIF3AQ9Y496 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KIF3AQ9Y496 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KIF3AQ9Y496 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
KIF3AQ9Y496 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KIF3AQ9Y496 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
KIF3AQ9Y496 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KIF3AQ9Y496 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
KIF3AQ9Y496 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KIF3AQ9Y496 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KIF3AQ9Y496 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
KIF3AQ9Y496 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
KIF3AQ9Y496 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
KIF3AQ9Y496 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KIF3AQ9Y496 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KIF3AQ9Y496 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
KIF3AQ9Y496 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
KIF3AQ9Y496 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KIF3AQ9Y496 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
KIF3AQ9Y496 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
KIF3AQ9Y496 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
KIF3AQ9Y496 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
KIF3AQ9Y496 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KIF3AQ9Y496 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
KIF3AQ9Y496 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
KIF3AQ9Y496 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KIF3AQ9Y496 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
KIF3AQ9Y496 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms