Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2W7

KCNIP3, Calsenilin, humanhuman

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNIP3Q9Y2W7 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KCNIP3Q9Y2W7 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KCNIP3Q9Y2W7 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KCNIP3Q9Y2W7 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KCNIP3Q9Y2W7 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KCNIP3Q9Y2W7 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KCNIP3Q9Y2W7 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KCNIP3Q9Y2W7 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KCNIP3Q9Y2W7 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KCNIP3Q9Y2W7 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KCNIP3Q9Y2W7 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KCNIP3Q9Y2W7 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KCNIP3Q9Y2W7 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KCNIP3Q9Y2W7 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KCNIP3Q9Y2W7 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KCNIP3Q9Y2W7 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
KCNIP3Q9Y2W7 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KCNIP3Q9Y2W7 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KCNIP3Q9Y2W7 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KCNIP3Q9Y2W7 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KCNIP3Q9Y2W7 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
KCNIP3Q9Y2W7 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KCNIP3Q9Y2W7 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KCNIP3Q9Y2W7 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KCNIP3Q9Y2W7 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KCNIP3Q9Y2W7 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KCNIP3Q9Y2W7 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KCNIP3Q9Y2W7 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KCNIP3Q9Y2W7 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KCNIP3Q9Y2W7 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KCNIP3Q9Y2W7 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KCNIP3Q9Y2W7 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KCNIP3Q9Y2W7 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
KCNIP3Q9Y2W7 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KCNIP3Q9Y2W7 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KCNIP3Q9Y2W7 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KCNIP3Q9Y2W7 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KCNIP3Q9Y2W7 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KCNIP3Q9Y2W7 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KCNIP3Q9Y2W7 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KCNIP3Q9Y2W7 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KCNIP3Q9Y2W7 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KCNIP3Q9Y2W7 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KCNIP3Q9Y2W7 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KCNIP3Q9Y2W7 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KCNIP3Q9Y2W7 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KCNIP3Q9Y2W7 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
KCNIP3Q9Y2W7 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
KCNIP3Q9Y2W7 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
KCNIP3Q9Y2W7 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
KCNIP3Q9Y2W7 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
KCNIP3Q9Y2W7 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
KCNIP3Q9Y2W7 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
KCNIP3Q9Y2W7 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
KCNIP3Q9Y2W7 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
KCNIP3Q9Y2W7 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
KCNIP3Q9Y2W7 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
KCNIP3Q9Y2W7 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
KCNIP3Q9Y2W7 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
KCNIP3Q9Y2W7 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
KCNIP3Q9Y2W7 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
KCNIP3Q9Y2W7 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
KCNIP3Q9Y2W7 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
KCNIP3Q9Y2W7 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
KCNIP3Q9Y2W7 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
KCNIP3Q9Y2W7 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
KCNIP3Q9Y2W7 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
KCNIP3Q9Y2W7 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
KCNIP3Q9Y2W7 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
KCNIP3Q9Y2W7 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
KCNIP3Q9Y2W7 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
KCNIP3Q9Y2W7 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
KCNIP3Q9Y2W7 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
KCNIP3Q9Y2W7 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
KCNIP3Q9Y2W7 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
KCNIP3Q9Y2W7 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
KCNIP3Q9Y2W7 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
KCNIP3Q9Y2W7 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
KCNIP3Q9Y2W7 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KCNIP3Q9Y2W7 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KCNIP3Q9Y2W7 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KCNIP3Q9Y2W7 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KCNIP3Q9Y2W7 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
KCNIP3Q9Y2W7 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
KCNIP3Q9Y2W7 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
KCNIP3Q9Y2W7 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
KCNIP3Q9Y2W7 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KCNIP3Q9Y2W7 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
KCNIP3Q9Y2W7 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
KCNIP3Q9Y2W7 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KCNIP3Q9Y2W7 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
KCNIP3Q9Y2W7 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
KCNIP3Q9Y2W7 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
KCNIP3Q9Y2W7 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
KCNIP3Q9Y2W7 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KCNIP3Q9Y2W7 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
KCNIP3Q9Y2W7 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KCNIP3Q9Y2W7 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KCNIP3Q9Y2W7 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
KCNIP3Q9Y2W7 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms