Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQF0

ERVW-1, Syncytin-1, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVW-1Q9UQF0 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ERVW-1Q9UQF0 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ERVW-1Q9UQF0 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ERVW-1Q9UQF0 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ERVW-1Q9UQF0 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ERVW-1Q9UQF0 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ERVW-1Q9UQF0 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ERVW-1Q9UQF0 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ERVW-1Q9UQF0 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ERVW-1Q9UQF0 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ERVW-1Q9UQF0 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ERVW-1Q9UQF0 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ERVW-1Q9UQF0 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ERVW-1Q9UQF0 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ERVW-1Q9UQF0 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ERVW-1Q9UQF0 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ERVW-1Q9UQF0 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
ERVW-1Q9UQF0 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ERVW-1Q9UQF0 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ERVW-1Q9UQF0 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ERVW-1Q9UQF0 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ERVW-1Q9UQF0 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
ERVW-1Q9UQF0 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ERVW-1Q9UQF0 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ERVW-1Q9UQF0 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ERVW-1Q9UQF0 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ERVW-1Q9UQF0 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
ERVW-1Q9UQF0 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ERVW-1Q9UQF0 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ERVW-1Q9UQF0 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ERVW-1Q9UQF0 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ERVW-1Q9UQF0 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ERVW-1Q9UQF0 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ERVW-1Q9UQF0 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ERVW-1Q9UQF0 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ERVW-1Q9UQF0 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
ERVW-1Q9UQF0 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ERVW-1Q9UQF0 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ERVW-1Q9UQF0 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ERVW-1Q9UQF0 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ERVW-1Q9UQF0 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ERVW-1Q9UQF0 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ERVW-1Q9UQF0 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ERVW-1Q9UQF0 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ERVW-1Q9UQF0 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ERVW-1Q9UQF0 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ERVW-1Q9UQF0 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ERVW-1Q9UQF0 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ERVW-1Q9UQF0 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ERVW-1Q9UQF0 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ERVW-1Q9UQF0 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ERVW-1Q9UQF0 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ERVW-1Q9UQF0 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ERVW-1Q9UQF0 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ERVW-1Q9UQF0 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ERVW-1Q9UQF0 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ERVW-1Q9UQF0 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ERVW-1Q9UQF0 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ERVW-1Q9UQF0 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ERVW-1Q9UQF0 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ERVW-1Q9UQF0 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ERVW-1Q9UQF0 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ERVW-1Q9UQF0 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ERVW-1Q9UQF0 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ERVW-1Q9UQF0 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
ERVW-1Q9UQF0 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ERVW-1Q9UQF0 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ERVW-1Q9UQF0 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ERVW-1Q9UQF0 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ERVW-1Q9UQF0 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ERVW-1Q9UQF0 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ERVW-1Q9UQF0 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ERVW-1Q9UQF0 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ERVW-1Q9UQF0 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ERVW-1Q9UQF0 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ERVW-1Q9UQF0 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ERVW-1Q9UQF0 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ERVW-1Q9UQF0 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ERVW-1Q9UQF0 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ERVW-1Q9UQF0 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ERVW-1Q9UQF0 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ERVW-1Q9UQF0 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ERVW-1Q9UQF0 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ERVW-1Q9UQF0 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ERVW-1Q9UQF0 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ERVW-1Q9UQF0 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ERVW-1Q9UQF0 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ERVW-1Q9UQF0 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ERVW-1Q9UQF0 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ERVW-1Q9UQF0 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ERVW-1Q9UQF0 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ERVW-1Q9UQF0 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ERVW-1Q9UQF0 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ERVW-1Q9UQF0 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ERVW-1Q9UQF0 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ERVW-1Q9UQF0 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ERVW-1Q9UQF0 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ERVW-1Q9UQF0 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ERVW-1Q9UQF0 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ERVW-1Q9UQF0 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms