Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPU3

SORCS3, VPS10 domain-containing receptor SorCS3, humanhuman

Predictions only

Length 1,222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SORCS3Q9UPU3 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
SORCS3Q9UPU3 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SORCS3Q9UPU3 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SORCS3Q9UPU3 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SORCS3Q9UPU3 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SORCS3Q9UPU3 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SORCS3Q9UPU3 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SORCS3Q9UPU3 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SORCS3Q9UPU3 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SORCS3Q9UPU3 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SORCS3Q9UPU3 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SORCS3Q9UPU3 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SORCS3Q9UPU3 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SORCS3Q9UPU3 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SORCS3Q9UPU3 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
SORCS3Q9UPU3 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SORCS3Q9UPU3 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SORCS3Q9UPU3 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SORCS3Q9UPU3 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SORCS3Q9UPU3 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SORCS3Q9UPU3 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SORCS3Q9UPU3 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SORCS3Q9UPU3 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SORCS3Q9UPU3 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SORCS3Q9UPU3 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.99
SORCS3Q9UPU3 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SORCS3Q9UPU3 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SORCS3Q9UPU3 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SORCS3Q9UPU3 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SORCS3Q9UPU3 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SORCS3Q9UPU3 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SORCS3Q9UPU3 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SORCS3Q9UPU3 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SORCS3Q9UPU3 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
SORCS3Q9UPU3 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SORCS3Q9UPU3 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SORCS3Q9UPU3 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SORCS3Q9UPU3 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SORCS3Q9UPU3 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SORCS3Q9UPU3 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SORCS3Q9UPU3 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SORCS3Q9UPU3 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SORCS3Q9UPU3 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SORCS3Q9UPU3 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SORCS3Q9UPU3 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SORCS3Q9UPU3 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SORCS3Q9UPU3 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SORCS3Q9UPU3 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SORCS3Q9UPU3 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SORCS3Q9UPU3 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SORCS3Q9UPU3 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SORCS3Q9UPU3 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SORCS3Q9UPU3 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SORCS3Q9UPU3 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SORCS3Q9UPU3 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SORCS3Q9UPU3 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SORCS3Q9UPU3 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SORCS3Q9UPU3 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SORCS3Q9UPU3 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SORCS3Q9UPU3 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SORCS3Q9UPU3 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SORCS3Q9UPU3 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
SORCS3Q9UPU3 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SORCS3Q9UPU3 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SORCS3Q9UPU3 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
SORCS3Q9UPU3 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SORCS3Q9UPU3 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SORCS3Q9UPU3 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SORCS3Q9UPU3 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SORCS3Q9UPU3 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SORCS3Q9UPU3 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SORCS3Q9UPU3 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SORCS3Q9UPU3 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SORCS3Q9UPU3 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
SORCS3Q9UPU3 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SORCS3Q9UPU3 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SORCS3Q9UPU3 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SORCS3Q9UPU3 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SORCS3Q9UPU3 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SORCS3Q9UPU3 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SORCS3Q9UPU3 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SORCS3Q9UPU3 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SORCS3Q9UPU3 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SORCS3Q9UPU3 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SORCS3Q9UPU3 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SORCS3Q9UPU3 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SORCS3Q9UPU3 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SORCS3Q9UPU3 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SORCS3Q9UPU3 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SORCS3Q9UPU3 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
SORCS3Q9UPU3 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SORCS3Q9UPU3 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SORCS3Q9UPU3 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SORCS3Q9UPU3 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
SORCS3Q9UPU3 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SORCS3Q9UPU3 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SORCS3Q9UPU3 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SORCS3Q9UPU3 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SORCS3Q9UPU3 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SORCS3Q9UPU3 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms