Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHP3

USP25, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 25, humanhuman

Predictions only

Length 1,055 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP25Q9UHP3 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
USP25Q9UHP3 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
USP25Q9UHP3 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
USP25Q9UHP3 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
USP25Q9UHP3 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
USP25Q9UHP3 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
USP25Q9UHP3 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
USP25Q9UHP3 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
USP25Q9UHP3 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
USP25Q9UHP3 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP25Q9UHP3 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP25Q9UHP3 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP25Q9UHP3 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP25Q9UHP3 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP25Q9UHP3 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP25Q9UHP3 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP25Q9UHP3 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP25Q9UHP3 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP25Q9UHP3 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
USP25Q9UHP3 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP25Q9UHP3 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
USP25Q9UHP3 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP25Q9UHP3 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP25Q9UHP3 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP25Q9UHP3 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP25Q9UHP3 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP25Q9UHP3 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP25Q9UHP3 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
USP25Q9UHP3 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
USP25Q9UHP3 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
USP25Q9UHP3 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
USP25Q9UHP3 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
USP25Q9UHP3 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
USP25Q9UHP3 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
USP25Q9UHP3 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
USP25Q9UHP3 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
USP25Q9UHP3 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
USP25Q9UHP3 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
USP25Q9UHP3 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
USP25Q9UHP3 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
USP25Q9UHP3 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
USP25Q9UHP3 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
USP25Q9UHP3 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
USP25Q9UHP3 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
USP25Q9UHP3 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP25Q9UHP3 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP25Q9UHP3 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP25Q9UHP3 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP25Q9UHP3 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP25Q9UHP3 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP25Q9UHP3 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP25Q9UHP3 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP25Q9UHP3 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP25Q9UHP3 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP25Q9UHP3 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP25Q9UHP3 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP25Q9UHP3 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP25Q9UHP3 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP25Q9UHP3 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP25Q9UHP3 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP25Q9UHP3 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP25Q9UHP3 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP25Q9UHP3 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP25Q9UHP3 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP25Q9UHP3 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP25Q9UHP3 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP25Q9UHP3 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP25Q9UHP3 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP25Q9UHP3 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP25Q9UHP3 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
USP25Q9UHP3 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP25Q9UHP3 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP25Q9UHP3 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP25Q9UHP3 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP25Q9UHP3 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP25Q9UHP3 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP25Q9UHP3 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP25Q9UHP3 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP25Q9UHP3 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP25Q9UHP3 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP25Q9UHP3 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP25Q9UHP3 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP25Q9UHP3 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP25Q9UHP3 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP25Q9UHP3 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
USP25Q9UHP3 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
USP25Q9UHP3 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
USP25Q9UHP3 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
USP25Q9UHP3 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
USP25Q9UHP3 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
USP25Q9UHP3 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
USP25Q9UHP3 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
USP25Q9UHP3 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
USP25Q9UHP3 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
USP25Q9UHP3 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
USP25Q9UHP3 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
USP25Q9UHP3 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
USP25Q9UHP3 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
USP25Q9UHP3 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP25Q9UHP3 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms