Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1F3

ABRACL, Costars family protein ABRACL, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABRACLQ9P1F3 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ABRACLQ9P1F3 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ABRACLQ9P1F3 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ABRACLQ9P1F3 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ABRACLQ9P1F3 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ABRACLQ9P1F3 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ABRACLQ9P1F3 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ABRACLQ9P1F3 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ABRACLQ9P1F3 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ABRACLQ9P1F3 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ABRACLQ9P1F3 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ABRACLQ9P1F3 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ABRACLQ9P1F3 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ABRACLQ9P1F3 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ABRACLQ9P1F3 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ABRACLQ9P1F3 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
ABRACLQ9P1F3 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ABRACLQ9P1F3 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
ABRACLQ9P1F3 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ABRACLQ9P1F3 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ABRACLQ9P1F3 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ABRACLQ9P1F3 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ABRACLQ9P1F3 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ABRACLQ9P1F3 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ABRACLQ9P1F3 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ABRACLQ9P1F3 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
ABRACLQ9P1F3 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ABRACLQ9P1F3 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ABRACLQ9P1F3 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ABRACLQ9P1F3 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
ABRACLQ9P1F3 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ABRACLQ9P1F3 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ABRACLQ9P1F3 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ABRACLQ9P1F3 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
ABRACLQ9P1F3 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ABRACLQ9P1F3 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ABRACLQ9P1F3 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ABRACLQ9P1F3 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ABRACLQ9P1F3 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ABRACLQ9P1F3 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ABRACLQ9P1F3 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ABRACLQ9P1F3 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ABRACLQ9P1F3 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ABRACLQ9P1F3 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ABRACLQ9P1F3 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ABRACLQ9P1F3 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ABRACLQ9P1F3 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ABRACLQ9P1F3 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ABRACLQ9P1F3 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ABRACLQ9P1F3 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ABRACLQ9P1F3 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ABRACLQ9P1F3 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
ABRACLQ9P1F3 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ABRACLQ9P1F3 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ABRACLQ9P1F3 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ABRACLQ9P1F3 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ABRACLQ9P1F3 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ABRACLQ9P1F3 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ABRACLQ9P1F3 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ABRACLQ9P1F3 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ABRACLQ9P1F3 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ABRACLQ9P1F3 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ABRACLQ9P1F3 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ABRACLQ9P1F3 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ABRACLQ9P1F3 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ABRACLQ9P1F3 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ABRACLQ9P1F3 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ABRACLQ9P1F3 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
ABRACLQ9P1F3 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ABRACLQ9P1F3 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ABRACLQ9P1F3 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ABRACLQ9P1F3 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ABRACLQ9P1F3 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ABRACLQ9P1F3 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ABRACLQ9P1F3 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ABRACLQ9P1F3 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ABRACLQ9P1F3 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ABRACLQ9P1F3 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ABRACLQ9P1F3 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
ABRACLQ9P1F3 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ABRACLQ9P1F3 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ABRACLQ9P1F3 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ABRACLQ9P1F3 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ABRACLQ9P1F3 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ABRACLQ9P1F3 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
ABRACLQ9P1F3 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ABRACLQ9P1F3 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ABRACLQ9P1F3 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ABRACLQ9P1F3 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ABRACLQ9P1F3 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ABRACLQ9P1F3 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
ABRACLQ9P1F3 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ABRACLQ9P1F3 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ABRACLQ9P1F3 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ABRACLQ9P1F3 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ABRACLQ9P1F3 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ABRACLQ9P1F3 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ABRACLQ9P1F3 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ABRACLQ9P1F3 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ABRACLQ9P1F3 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms