Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX63

CHCHD3, MICOS complex subunit MIC19, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD3Q9NX63 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CHCHD3Q9NX63 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CHCHD3Q9NX63 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CHCHD3Q9NX63 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CHCHD3Q9NX63 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CHCHD3Q9NX63 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CHCHD3Q9NX63 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CHCHD3Q9NX63 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CHCHD3Q9NX63 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CHCHD3Q9NX63 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CHCHD3Q9NX63 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CHCHD3Q9NX63 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CHCHD3Q9NX63 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CHCHD3Q9NX63 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CHCHD3Q9NX63 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CHCHD3Q9NX63 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CHCHD3Q9NX63 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CHCHD3Q9NX63 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CHCHD3Q9NX63 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CHCHD3Q9NX63 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CHCHD3Q9NX63 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CHCHD3Q9NX63 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CHCHD3Q9NX63 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CHCHD3Q9NX63 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CHCHD3Q9NX63 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CHCHD3Q9NX63 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CHCHD3Q9NX63 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CHCHD3Q9NX63 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CHCHD3Q9NX63 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CHCHD3Q9NX63 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CHCHD3Q9NX63 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CHCHD3Q9NX63 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CHCHD3Q9NX63 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CHCHD3Q9NX63 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CHCHD3Q9NX63 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CHCHD3Q9NX63 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CHCHD3Q9NX63 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CHCHD3Q9NX63 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CHCHD3Q9NX63 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
CHCHD3Q9NX63 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CHCHD3Q9NX63 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CHCHD3Q9NX63 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
CHCHD3Q9NX63 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CHCHD3Q9NX63 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CHCHD3Q9NX63 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CHCHD3Q9NX63 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CHCHD3Q9NX63 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CHCHD3Q9NX63 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CHCHD3Q9NX63 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CHCHD3Q9NX63 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CHCHD3Q9NX63 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CHCHD3Q9NX63 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CHCHD3Q9NX63 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CHCHD3Q9NX63 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CHCHD3Q9NX63 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CHCHD3Q9NX63 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CHCHD3Q9NX63 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CHCHD3Q9NX63 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CHCHD3Q9NX63 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CHCHD3Q9NX63 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CHCHD3Q9NX63 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CHCHD3Q9NX63 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CHCHD3Q9NX63 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CHCHD3Q9NX63 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CHCHD3Q9NX63 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CHCHD3Q9NX63 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CHCHD3Q9NX63 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CHCHD3Q9NX63 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CHCHD3Q9NX63 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CHCHD3Q9NX63 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CHCHD3Q9NX63 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CHCHD3Q9NX63 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CHCHD3Q9NX63 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CHCHD3Q9NX63 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CHCHD3Q9NX63 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CHCHD3Q9NX63 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CHCHD3Q9NX63 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CHCHD3Q9NX63 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CHCHD3Q9NX63 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
CHCHD3Q9NX63 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CHCHD3Q9NX63 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CHCHD3Q9NX63 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CHCHD3Q9NX63 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CHCHD3Q9NX63 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CHCHD3Q9NX63 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CHCHD3Q9NX63 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CHCHD3Q9NX63 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CHCHD3Q9NX63 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CHCHD3Q9NX63 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CHCHD3Q9NX63 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CHCHD3Q9NX63 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CHCHD3Q9NX63 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CHCHD3Q9NX63 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CHCHD3Q9NX63 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CHCHD3Q9NX63 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CHCHD3Q9NX63 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CHCHD3Q9NX63 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CHCHD3Q9NX63 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CHCHD3Q9NX63 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CHCHD3Q9NX63 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.8 ms